More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3070 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  569  1e-161  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3141  hypothetical protein  51.52 
 
 		 297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  51.01 
 
 		 297 aa  212  7e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  43.77 
 
 		 295 aa  205  7e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3071  hypothetical protein  48.97 
 
 		 317 aa  182  8.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  41.64 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  38.54 
 
 		 303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  52.82 
 
 		 151 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  31.51 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  47.3 
 
 		 152 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  34.3 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  34.3 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  34.3 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  30.67 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  29.83 
 
 		 289 aa  94.7  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0104  hypothetical protein  47.65 
 
 		 149 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  27.55 
 
 		 288 aa  93.6  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  38.62 
 
 		 149 aa  88.6  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  32 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  29.51 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  28.48 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  30.32 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  35.71 
 
 		 164 aa  84  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  30 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  33.12 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  30.9 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  28.53 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  29.19 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  27.85 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  28.06 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  35.97 
 
 		 137 aa  80.9  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  35.03 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  33.44 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3072  hypothetical protein  41.06 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 		 137 aa  80.5  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  30.92 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  35.69 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  30.38 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  30.87 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  28.52 
 
 		 307 aa  79  0.00000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  36.18 
 
 		 294 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  31.56 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  26.8 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  28.43 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  32.27 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  31.69 
 
 		 142 aa  78.6  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  32.27 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2716  hypothetical protein  40.25 
 
 		 168 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  32.27 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 		 148 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  34.51 
 
 		 151 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  34.29 
 
 		 142 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  32.68 
 
 		 142 aa  77.8  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  36.99 
 
 		 150 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  26.14 
 
 		 449 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  32.23 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  23.51 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  33.22 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  31.89 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  37.16 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  29.87 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  31.23 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  31.23 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  33.8 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  32.61 
 
 		 139 aa  75.5  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  31.86 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  28.38 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  39.72 
 
 		 138 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  29.14 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  32.17 
 
 		 148 aa  74.7  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  37.24 
 
 		 148 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  31.97 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  35.61 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  30.03 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4486  hypothetical protein  29.58 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  31.56 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  30.03 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3500  UspA domain protein  28.38 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  29.43 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  30.25 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  32.39 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  38.41 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  28.09 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  34.46 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  34.78 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3655  UspA domain protein  27.87 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00313868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2454  UspA domain protein  27.87 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  34.74 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  36.23 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  29.81 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  29.8 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  29.71 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  29.71 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>