More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1606 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  100 
 
 
145 aa  284  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  97.24 
 
 
145 aa  278  2e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  95.86 
 
 
145 aa  273  8e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  83.45 
 
 
145 aa  249  1e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  65.52 
 
 
148 aa  202  1e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  47.52 
 
 
150 aa  144  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  45.39 
 
 
150 aa  137  4.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  43.54 
 
 
157 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  41.84 
 
 
180 aa  127  7.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  44.85 
 
 
141 aa  123  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  46.81 
 
 
149 aa  122  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  39.29 
 
 
164 aa  122  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  43.97 
 
 
152 aa  119  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  40.82 
 
 
150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  40.43 
 
 
158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  39.72 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  43.36 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  41.78 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  42.96 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  43.48 
 
 
147 aa  108  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  42.66 
 
 
148 aa  105  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  40.28 
 
 
148 aa  104  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  44.37 
 
 
144 aa  103  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  38.24 
 
 
165 aa  103  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  41.13 
 
 
144 aa  103  8e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  37.33 
 
 
144 aa  102  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  36.49 
 
 
155 aa  102  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  37.5 
 
 
156 aa  102  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  40.62 
 
 
130 aa  100  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  32.87 
 
 
307 aa  99.8  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  39.42 
 
 
143 aa  99  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  39.86 
 
 
140 aa  98.6  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  36.42 
 
 
153 aa  98.6  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  35.46 
 
 
142 aa  98.2  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  36.62 
 
 
142 aa  97.8  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 
145 aa  97.4  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  37.32 
 
 
144 aa  97.1  7e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  37.84 
 
 
159 aa  96.3  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  37.58 
 
 
153 aa  96.3  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  38.36 
 
 
152 aa  96.3  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  37.25 
 
 
200 aa  95.9  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  35.33 
 
 
156 aa  95.1  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 
148 aa  94.7  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 
156 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 
143 aa  94.7  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  34.03 
 
 
208 aa  94  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  38.3 
 
 
145 aa  94  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 
156 aa  94  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  35.42 
 
 
290 aa  93.6  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  36.24 
 
 
305 aa  94  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  39.57 
 
 
141 aa  93.6  9e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  34.67 
 
 
156 aa  92.8  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  35.42 
 
 
147 aa  92  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  36.43 
 
 
153 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  40.14 
 
 
145 aa  91.7  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  37.67 
 
 
145 aa  91.3  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  36.88 
 
 
150 aa  91.3  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  36.43 
 
 
300 aa  90.9  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 
142 aa  90.5  8e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  36.6 
 
 
200 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  36.6 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  36.6 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  36.6 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  36.6 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  37.24 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  39.16 
 
 
145 aa  90.1  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.577691 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  36.11 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  36.6 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  34.93 
 
 
149 aa  89.4  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  34.04 
 
 
297 aa  88.2  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  39.17 
 
 
120 aa  88.2  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  36.81 
 
 
153 aa  87.8  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  32.64 
 
 
207 aa  87.4  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 
153 aa  87.4  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 
149 aa  87.4  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 
157 aa  87.4  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  36.43 
 
 
142 aa  87  8e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  37.24 
 
 
147 aa  86.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  34.46 
 
 
168 aa  86.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 
162 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  33.1 
 
 
150 aa  85.5  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  34.75 
 
 
138 aa  85.1  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1929  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 
146 aa  85.1  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  34 
 
 
184 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  35.29 
 
 
167 aa  84.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  35.21 
 
 
280 aa  84.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1732  UspA domain protein  39.31 
 
 
146 aa  84.7  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  32.86 
 
 
287 aa  84.7  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  84.3  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  33.57 
 
 
140 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  33.57 
 
 
283 aa  84.3  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  35.53 
 
 
149 aa  84.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  35.42 
 
 
145 aa  84.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  38.82 
 
 
163 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 
157 aa  84  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  35.92 
 
 
136 aa  83.6  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 
142 aa  84  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
151 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  33.11 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>