More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1627 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 274 aa  555  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  54.71 
 
 		 276 aa  305  5.0000000000000004e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  38.21 
 
 		 289 aa  208  9e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  39.64 
 
 		 275 aa  202  6e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  38.91 
 
 		 288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 		 278 aa  159  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  29.43 
 
 		 277 aa  154  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  31.79 
 
 		 282 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3549  UspA domain protein  30.66 
 
 		 278 aa  139  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3570  UspA domain protein  32.26 
 
 		 271 aa  135  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.610605 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  28.57 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  26.17 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  26.74 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  28.42 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  26.25 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  27.85 
 
 		 314 aa  105  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  28.47 
 
 		 290 aa  102  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2708  UspA domain-containing protein  26.35 
 
 		 277 aa  99  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0505017  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  25.17 
 
 		 287 aa  98.6  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1652  UspA domain protein  25 
 
 		 270 aa  96.3  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.432641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  25.44 
 
 		 297 aa  95.9  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  23.84 
 
 		 291 aa  90.5  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  25.5 
 
 		 305 aa  89.4  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  26.04 
 
 		 300 aa  89.4  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0502  UspA domain protein  29.5 
 
 		 277 aa  89  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  26.13 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1135  universal stress protein  23.83 
 
 		 281 aa  88.2  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00245865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  34.04 
 
 		 153 aa  87.4  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  22.22 
 
 		 281 aa  87  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  23.59 
 
 		 306 aa  87  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  25.17 
 
 		 325 aa  87  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  22.82 
 
 		 287 aa  85.9  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.97 
 
 		 153 aa  85.9  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  22.56 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  23.71 
 
 		 283 aa  85.1  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  23.68 
 
 		 449 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 151 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  23.33 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  31.72 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  25.6 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  32.03 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1035  UspA domain protein  26.69 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  30.77 
 
 		 153 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  24.13 
 
 		 282 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  30.77 
 
 		 153 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0674  universal stress protein  24.02 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  34.72 
 
 		 153 aa  80.9  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  30.82 
 
 		 159 aa  80.5  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  30.77 
 
 		 153 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  34.93 
 
 		 155 aa  81.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  20.74 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  23.33 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  24.81 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  32.05 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  32.05 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  23.69 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  21.55 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  22.81 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  25 
 
 		 286 aa  78.6  0.00000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 145 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  27.78 
 
 		 149 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0871  UspA domain protein  25.28 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.225808  normal  0.70038 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  31.97 
 
 		 159 aa  77.4  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  23.89 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  32.64 
 
 		 156 aa  77.4  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  25.35 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  29.86 
 
 		 152 aa  77  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  32.69 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  32.21 
 
 		 151 aa  77  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 155 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  32.67 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  35.57 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  22.15 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  20.09 
 
 		 301 aa  75.5  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  24.14 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  34.27 
 
 		 144 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2256  UspA domain-containing protein  24.5 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 144 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  31.97 
 
 		 152 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  26.39 
 
 		 149 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  30.61 
 
 		 156 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  31.33 
 
 		 154 aa  74.7  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  30.5 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  20.98 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  18.86 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  30.99 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  29.66 
 
 		 152 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  31.72 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  30.77 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  29.24 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  33.12 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  29.94 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  26.49 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  22.38 
 
 		 341 aa  72.4  0.000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  33.77 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  31.97 
 
 		 139 aa  72  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>