More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0289 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  100 
 
 		 289 aa  596  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  74.91 
 
 		 288 aa  464  9.999999999999999e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  55.47 
 
 		 278 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  47.45 
 
 		 277 aa  265  5e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  38.21 
 
 		 274 aa  208  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  34.53 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  30.5 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3549  UspA domain protein  30.39 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  30 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3570  UspA domain protein  31.41 
 
 		 271 aa  115  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.610605 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  28.43 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  29.68 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  28.22 
 
 		 288 aa  98.6  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  29.97 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  29.15 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  30.26 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  27.76 
 
 		 300 aa  88.2  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  28.96 
 
 		 290 aa  86.7  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  25.84 
 
 		 305 aa  86.7  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  28.77 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  29.07 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0871  UspA domain protein  31.02 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.225808  normal  0.70038 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  33.78 
 
 		 149 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  34 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  35.21 
 
 		 152 aa  81.6  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  38.03 
 
 		 162 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  34.67 
 
 		 170 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  34.03 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  35.46 
 
 		 162 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  38.03 
 
 		 162 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  34.67 
 
 		 170 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 151 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  37.06 
 
 		 150 aa  81.3  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  26.25 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  29.37 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  37.14 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  30.99 
 
 		 153 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  30.99 
 
 		 153 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  35.71 
 
 		 180 aa  78.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  33.1 
 
 		 159 aa  78.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2717  UspA domain-containing protein  30.29 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  26.53 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  35.77 
 
 		 159 aa  77.4  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  27.49 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  30.99 
 
 		 153 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  34.67 
 
 		 169 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1135  universal stress protein  23.94 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00245865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  33.1 
 
 		 153 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  35.51 
 
 		 156 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  32.89 
 
 		 151 aa  77  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  32.24 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  33.1 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  38.62 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  37.14 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  27.88 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  32.24 
 
 		 157 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  36.96 
 
 		 162 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 145 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  32.64 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0502  UspA domain protein  28.5 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  31.76 
 
 		 155 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  34.06 
 
 		 158 aa  73.9  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  26.53 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  26.62 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  27.87 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  35.66 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  27.12 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1652  UspA domain protein  25.57 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.432641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 		 153 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.03 
 
 		 153 aa  72  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  32.7 
 
 		 156 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  28.19 
 
 		 169 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  25.43 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 		 138 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  32.88 
 
 		 152 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  30.99 
 
 		 152 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3712  universal stress protein  27.6 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  32.67 
 
 		 154 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  32.03 
 
 		 147 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  30.87 
 
 		 152 aa  70.9  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  24.32 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 		 162 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  32.41 
 
 		 148 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2256  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  32.62 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  31.51 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  28.57 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  33.33 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  34.25 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  30.41 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0923  UspA domain-containing protein  25.08 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.792635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>