More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0812 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  100 
 
 
153 aa  309  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  99.35 
 
 
153 aa  307  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  98.04 
 
 
153 aa  306  5e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  79.73 
 
 
151 aa  240  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  44.76 
 
 
156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  46.85 
 
 
162 aa  120  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4067  UspA domain-containing protein  45.95 
 
 
137 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483975  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  46.48 
 
 
162 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  46.85 
 
 
162 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  48.97 
 
 
164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  46.85 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  46.85 
 
 
162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  45.14 
 
 
164 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  44.44 
 
 
164 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2768  UspA domain protein  46.94 
 
 
134 aa  103  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.327579  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2675  universal stress protein UspA  46.26 
 
 
134 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2861  UspA domain protein  46.94 
 
 
134 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.569855  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  41.38 
 
 
170 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  41.38 
 
 
170 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  37.91 
 
 
159 aa  96.7  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  35.14 
 
 
147 aa  93.6  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  37.59 
 
 
153 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2791  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 
155 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119476  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  40.69 
 
 
169 aa  91.7  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  34.01 
 
 
149 aa  90.9  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  39.29 
 
 
150 aa  90.1  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  35.86 
 
 
151 aa  90.1  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  36.05 
 
 
320 aa  89.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  35.66 
 
 
145 aa  88.6  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  36.49 
 
 
149 aa  88.2  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  36.88 
 
 
153 aa  87.8  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  38.26 
 
 
145 aa  87.8  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
147 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  38.41 
 
 
152 aa  86.3  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 
153 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  35.66 
 
 
145 aa  83.6  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  37.24 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3093  UspA domain-containing protein  46.15 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.668919  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  33.1 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  31.08 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 
449 aa  81.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  32.67 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 
274 aa  81.3  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  31.94 
 
 
290 aa  80.9  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  32.65 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 
145 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  40 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  32.03 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  40 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  30.99 
 
 
289 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  37.59 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  35.67 
 
 
155 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  31.85 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  35.46 
 
 
305 aa  77.4  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3830  universal stress family protein  35.53 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0606263 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  34.29 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  32.64 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  38.3 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  31.17 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  36.6 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  35.51 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2501  UspA domain protein  35.21 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432858  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  32.64 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0070  UspA domain protein  37.86 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  35.06 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  28.1 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  32.89 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  34.42 
 
 
155 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  34.42 
 
 
155 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  29.61 
 
 
157 aa  73.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0850  universal stress protein UspA  41.61 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.789221  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  29.87 
 
 
314 aa  73.2  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  31.9 
 
 
304 aa  72.8  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  38.89 
 
 
141 aa  73.6  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  34.46 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  34.25 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  34.42 
 
 
155 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  34.42 
 
 
155 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  32.47 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  33.13 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3713  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  38.03 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  34.51 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  33.11 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  34.01 
 
 
180 aa  72  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  39.86 
 
 
138 aa  72  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
148 aa  72  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
155 aa  72  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  33.77 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  34.64 
 
 
163 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>