More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3082 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  100 
 
 
138 aa  270  6e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  58.7 
 
 
136 aa  162  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  45.65 
 
 
138 aa  124  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  47.14 
 
 
140 aa  116  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  43.57 
 
 
140 aa  113  8.999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  45.32 
 
 
145 aa  112  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  45 
 
 
144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  39.86 
 
 
142 aa  111  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  42.03 
 
 
147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  44.29 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  47.41 
 
 
137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  46.38 
 
 
150 aa  107  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  44.2 
 
 
141 aa  106  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3615  UspA domain protein  44.85 
 
 
176 aa  102  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0603569  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  36.81 
 
 
149 aa  102  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  42.34 
 
 
139 aa  101  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  41.43 
 
 
142 aa  100  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  42.45 
 
 
138 aa  100  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1243  UspA domain protein  43.8 
 
 
139 aa  100  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.169034 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  40.88 
 
 
139 aa  94.7  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  41.48 
 
 
145 aa  93.6  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  43.48 
 
 
142 aa  93.6  9e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  44.6 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  42.45 
 
 
141 aa  92  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  42.14 
 
 
143 aa  90.5  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  40.74 
 
 
144 aa  87.8  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1734  UspA domain protein  42.45 
 
 
142 aa  85.9  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1980  UspA domain protein  41.89 
 
 
150 aa  85.1  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal  0.0911055 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  39.86 
 
 
180 aa  84.3  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2068  UspA domain protein  41.91 
 
 
145 aa  84  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  36.49 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  40 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3824  UspA domain protein  38.97 
 
 
295 aa  80.5  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  34.87 
 
 
305 aa  76.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  32.41 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  37.09 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  35.77 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  37.09 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  39.01 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  31.39 
 
 
297 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  43.82 
 
 
169 aa  74.3  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  34.06 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  36.3 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3822  UspA domain protein  35.76 
 
 
159 aa  72  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  41.98 
 
 
145 aa  72  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  34.29 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4252  UspA domain protein  33.55 
 
 
295 aa  71.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  29.5 
 
 
151 aa  72  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  37.09 
 
 
169 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  30.43 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  41.98 
 
 
145 aa  70.1  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  35.66 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  32.19 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  35.42 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  32.37 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  38.69 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  50.82 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  38.19 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  33.11 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  41.98 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  30 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  31.16 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  33.81 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  33.11 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  30.71 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  31.91 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  34.27 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  36.45 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  35.25 
 
 
288 aa  67.4  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  46.74 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  30.71 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  38.19 
 
 
304 aa  67  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.13 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2057  UspA domain protein  31.16 
 
 
137 aa  67  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.612176  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 
151 aa  66.6  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  32.87 
 
 
146 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  32.61 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  32.61 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3808  UspA domain protein  34.23 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  31.62 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  31.46 
 
 
120 aa  65.5  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  32.19 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  32.14 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  41.98 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  38.27 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  32.65 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  35.04 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  48.33 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  32.86 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  31.39 
 
 
297 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0065  UspA domain protein  33.57 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  34.06 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  28.99 
 
 
212 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  34.51 
 
 
307 aa  64.3  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>