More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1120 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  100 
 
 
140 aa  268  1e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  48.94 
 
 
141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  50.7 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  47.52 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  45.39 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1734  UspA domain protein  48.28 
 
 
142 aa  105  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  47.83 
 
 
136 aa  105  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1243  UspA domain protein  43.57 
 
 
139 aa  104  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.169034 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  43.57 
 
 
139 aa  104  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  49.66 
 
 
150 aa  102  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  40.71 
 
 
139 aa  99.8  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  42.25 
 
 
142 aa  99.4  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3615  UspA domain protein  42.45 
 
 
176 aa  95.9  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0603569  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  42.57 
 
 
145 aa  96.7  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  48.57 
 
 
140 aa  95.5  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  39.44 
 
 
142 aa  95.5  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  46.38 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  41.55 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  41.73 
 
 
140 aa  93.6  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  44.6 
 
 
138 aa  93.2  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  40.58 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  43.75 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  43.06 
 
 
144 aa  86.3  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  38.51 
 
 
149 aa  85.9  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1980  UspA domain protein  42.21 
 
 
150 aa  84  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal  0.0911055 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3824  UspA domain protein  41.73 
 
 
295 aa  84  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  45.07 
 
 
283 aa  84  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  38.67 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  43.45 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4252  UspA domain protein  39.07 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  36.42 
 
 
156 aa  79  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  40 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  39.33 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  37.33 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  40.14 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2068  UspA domain protein  38.3 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  40 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  38.26 
 
 
169 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  35.76 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  41.22 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  37.24 
 
 
287 aa  69.3  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  34.39 
 
 
305 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  35.81 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  38.56 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  35.21 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2057  UspA domain protein  37.96 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.612176  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  32.89 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3822  UspA domain protein  36.54 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1272  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.828897 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0904  UspA domain protein  39.74 
 
 
151 aa  67  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.633765  normal  0.56793 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  31.79 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  33.57 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  37.76 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  32.43 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  37.33 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  38.46 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  37.33 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  34.03 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  37.67 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  34.97 
 
 
307 aa  63.9  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  32.17 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.499037 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  32.43 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  32.43 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 
151 aa  63.5  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  32.05 
 
 
515 aa  63.9  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  30.71 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  33.11 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  37.59 
 
 
300 aa  63.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  34.03 
 
 
153 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2643  universal stress protein UspA-like protein  32.28 
 
 
168 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.795343  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  35 
 
 
306 aa  62.8  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  36.49 
 
 
153 aa  62.8  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  36.18 
 
 
301 aa  62  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  32.47 
 
 
155 aa  62  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  36.62 
 
 
415 aa  62  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  33.33 
 
 
153 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  34.03 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  32.88 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 
140 aa  62  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  36.36 
 
 
152 aa  62.4  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 
145 aa  62  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  34.97 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  34.97 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  29.41 
 
 
144 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  32.05 
 
 
150 aa  61.2  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1848  UspA family nucleotide-binding protein  36.55 
 
 
147 aa  61.2  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  35 
 
 
290 aa  61.6  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  36.55 
 
 
297 aa  61.2  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  34.93 
 
 
169 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 
167 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 
153 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  36.67 
 
 
152 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>