More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0592 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  100 
 
 
139 aa  274  3e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  51.08 
 
 
141 aa  146  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  48.53 
 
 
140 aa  144  3e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  52.14 
 
 
143 aa  142  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  53.19 
 
 
144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  43.88 
 
 
137 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  43.17 
 
 
137 aa  113  7.999999999999999e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  42.45 
 
 
137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  43.17 
 
 
137 aa  110  5e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  38.85 
 
 
150 aa  102  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  41.13 
 
 
164 aa  99  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  41.3 
 
 
165 aa  97.1  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  41.73 
 
 
149 aa  95.9  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  35.97 
 
 
150 aa  94.4  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 
128 aa  94.4  5e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  41.01 
 
 
128 aa  92.8  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  38.3 
 
 
138 aa  90.1  8e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  38.73 
 
 
143 aa  90.1  9e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  34.27 
 
 
156 aa  88.2  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  33.8 
 
 
150 aa  87.8  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  34.46 
 
 
148 aa  87  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  36 
 
 
155 aa  85.5  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  34.75 
 
 
320 aa  85.5  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  34.97 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  36.88 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.499037 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  35.25 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  35.77 
 
 
140 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  32.21 
 
 
157 aa  82  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  35.25 
 
 
290 aa  82  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  35.92 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  34.29 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  40.16 
 
 
130 aa  80.9  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  34.53 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  32.86 
 
 
148 aa  80.1  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  33.79 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  35.66 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  30.5 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0674  UspA domain-containing protein  38.57 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  33.8 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  34.03 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  32.64 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  31.88 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 
138 aa  77.8  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  32.41 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  32.12 
 
 
159 aa  77  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  40.14 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  35.51 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  34.97 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  36.3 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  35.86 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  38.46 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  32.61 
 
 
300 aa  75.5  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  30.56 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3170  UspA domain protein  34.07 
 
 
167 aa  74.7  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  28.99 
 
 
296 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  34.06 
 
 
297 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  37.06 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  35.81 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  34.06 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  31.43 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  33.33 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  34.69 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  35.81 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  35.81 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  36.36 
 
 
166 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  36.36 
 
 
166 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  33.57 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  35.25 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  37.16 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  34.27 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  34.27 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  31.65 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  37.5 
 
 
280 aa  72.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  34.27 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  34.48 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  34.27 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  31.39 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  34.27 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  33.8 
 
 
140 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  31.51 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  31.65 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  32.41 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  32.09 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1862  UspA domain protein  35.04 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0496809 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  38.62 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  34.06 
 
 
138 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
157 aa  72  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>