More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2327 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  100 
 
 
139 aa  278  2e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  64.03 
 
 
139 aa  187  2.9999999999999997e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  63.12 
 
 
141 aa  176  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1243  UspA domain protein  61.87 
 
 
139 aa  172  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.169034 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1734  UspA domain protein  56.34 
 
 
142 aa  147  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  45.83 
 
 
144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  43.57 
 
 
140 aa  104  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  43.48 
 
 
138 aa  103  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  44.06 
 
 
141 aa  102  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  41.67 
 
 
142 aa  100  8e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  43.26 
 
 
145 aa  99.8  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  40.97 
 
 
144 aa  97.4  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  39.86 
 
 
149 aa  97.1  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  40.88 
 
 
138 aa  94.7  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3615  UspA domain protein  41.43 
 
 
176 aa  94  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0603569  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  39.72 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  41.96 
 
 
143 aa  91.7  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  40.69 
 
 
145 aa  91.3  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  42.07 
 
 
150 aa  91.3  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  35.92 
 
 
142 aa  90.1  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  40.71 
 
 
137 aa  85.5  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1524  UspA domain protein  37.93 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0456308  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3822  UspA domain protein  37.42 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  36.73 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2068  UspA domain protein  39.72 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3824  UspA domain protein  36.69 
 
 
295 aa  78.6  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  33.09 
 
 
140 aa  77.8  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  37.58 
 
 
180 aa  77  0.00000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  36.5 
 
 
136 aa  76.6  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  34.51 
 
 
147 aa  76.6  0.00000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  35.46 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  37.76 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0904  UspA domain protein  40.79 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.633765  normal  0.56793 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  38.46 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  33.33 
 
 
138 aa  73.6  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 
140 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  34.9 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  37.41 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1980  UspA domain protein  33.99 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal  0.0911055 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  31.69 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  38.73 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4252  UspA domain protein  33.77 
 
 
295 aa  68.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3808  UspA domain protein  33.33 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 
153 aa  67  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  32.19 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  31.43 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  35.9 
 
 
305 aa  65.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  30 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  35.37 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  29.5 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  33.33 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  30.82 
 
 
142 aa  63.5  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1272  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 
138 aa  63.5  0.0000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.828897 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 
139 aa  62  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  29.58 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  30.07 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  37.59 
 
 
287 aa  62  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  32.19 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  30.28 
 
 
141 aa  60.8  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  35.56 
 
 
294 aa  60.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3480  UspA domain protein  35.57 
 
 
155 aa  60.8  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 
147 aa  60.8  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  35.17 
 
 
156 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  30.14 
 
 
154 aa  59.7  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  32.86 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  27.89 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  33.77 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  33.33 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  33.1 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1110  UspA domain protein  36.99 
 
 
313 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237274  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  30.87 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 
290 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 
128 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  31.51 
 
 
149 aa  58.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2057  UspA domain protein  29.93 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.612176  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  33.33 
 
 
304 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  31.87 
 
 
515 aa  58.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  36.05 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  29.37 
 
 
286 aa  58.2  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  31.82 
 
 
169 aa  57.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  38.3 
 
 
288 aa  58.2  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  28.17 
 
 
149 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 
140 aa  57.8  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  27.59 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  28.08 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2210  universal stress protein UspA  34.03 
 
 
149 aa  57  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  30.97 
 
 
170 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  30.77 
 
 
154 aa  57  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  30.97 
 
 
170 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  32.59 
 
 
156 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  33.55 
 
 
155 aa  57  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  29.73 
 
 
159 aa  57  0.00000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  29.5 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1626  UspA domain protein  31.01 
 
 
157 aa  56.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>