48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1626 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1626  UspA domain protein  100 
 
 
157 aa  312  9.999999999999999e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4822  hypothetical protein  55.77 
 
 
168 aa  171  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  37.97 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  35.44 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  32.93 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1734  UspA domain protein  33.54 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  32.91 
 
 
150 aa  63.5  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  31.65 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  27.22 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  31.65 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  31.01 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  28.21 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  31.01 
 
 
139 aa  56.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  32.91 
 
 
145 aa  55.1  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3615  UspA domain protein  33.96 
 
 
176 aa  54.7  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0603569  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  31.21 
 
 
139 aa  54.7  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  32.26 
 
 
138 aa  54.3  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3824  UspA domain protein  32.48 
 
 
295 aa  54.3  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2068  UspA domain protein  29.75 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  29.75 
 
 
138 aa  53.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  32.91 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  33.33 
 
 
136 aa  53.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  27.85 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2057  UspA domain protein  30.97 
 
 
137 aa  50.4  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.612176  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1243  UspA domain protein  29.75 
 
 
139 aa  50.8  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.169034 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  36.84 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  27.56 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  36.42 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  32.1 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  39.02 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  27.85 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  29.03 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  36.84 
 
 
301 aa  44.7  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  32.5 
 
 
141 aa  44.7  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  26.09 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1524  UspA domain protein  30.71 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0456308  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2722  UspA domain protein  26 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  34.02 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  28.48 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  33.77 
 
 
180 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  35.06 
 
 
152 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0067  UspA domain protein  43.64 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0416151  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  28.05 
 
 
151 aa  41.2  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  26.44 
 
 
120 aa  41.2  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1980  UspA domain protein  27.65 
 
 
150 aa  40.8  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal  0.0911055 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  30.77 
 
 
146 aa  40.8  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  33.06 
 
 
140 aa  40.4  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.499037 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  31.25 
 
 
286 aa  40.4  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>