More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1803 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  100 
 
 
143 aa  283  5.999999999999999e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  41.55 
 
 
142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  37.58 
 
 
160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  39.44 
 
 
140 aa  87.8  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  34.25 
 
 
145 aa  87  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 
140 aa  82  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  30.07 
 
 
140 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  30.07 
 
 
140 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  30.07 
 
 
140 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  30.07 
 
 
140 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  30.07 
 
 
140 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  30.77 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  30.77 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  33.33 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  29.37 
 
 
140 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  36.55 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  29.37 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  34.69 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  32.87 
 
 
139 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  36.81 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  33.81 
 
 
345 aa  71.6  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  32.19 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0023  universal stress protein  31.47 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  30.67 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 
140 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4155  UspA domain-containing protein  36.23 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  35.46 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  35.92 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  35.81 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  32.37 
 
 
341 aa  68.2  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  30.56 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  31.33 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  31.69 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  34.75 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  29.08 
 
 
150 aa  67  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1272  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 
138 aa  67  0.00000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.828897 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
145 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  30.61 
 
 
150 aa  67  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  31.97 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1569  universal stress protein  35.81 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  38.03 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  33.33 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1559  UspA domain protein  32.87 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.411505 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3824  UspA domain protein  34.51 
 
 
295 aa  65.5  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0806  UspA domain-containing protein  35.04 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0671262  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  35 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  31.97 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  31.65 
 
 
280 aa  64.3  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  32.37 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  33.33 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3264  UspA domain protein  28.99 
 
 
141 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  34.27 
 
 
150 aa  63.5  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0159  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 
157 aa  63.5  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906584  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 
170 aa  63.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  31.97 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
142 aa  63.5  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  34.97 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  30.13 
 
 
180 aa  63.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  34.97 
 
 
140 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  33.11 
 
 
290 aa  63.5  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  34.97 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  30.87 
 
 
168 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  31.54 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  29.86 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 
142 aa  62.8  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2428  universal stress protein  34.46 
 
 
191 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  33.11 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1230  universal stress family protein  34.46 
 
 
201 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296096  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  31.51 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  35.71 
 
 
300 aa  62.4  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1156  universal stress family protein  34.46 
 
 
201 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  30.56 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0705  universal stress protein  34.01 
 
 
152 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.284573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>