More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0597 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 170 aa  331  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4478  UspA domain-containing protein  70.59 
 
 		 164 aa  217  7.999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0550  UspA domain-containing protein  54.43 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3142  UspA domain protein  59.63 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3869  UspA domain-containing protein  61.59 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.36333 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1666  hypothetical protein  52.94 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.448158  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3866  hypothetical protein  35.62 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  32.62 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1204  hypothetical protein  31.91 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  34.04 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  30.99 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  33.75 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3264  UspA domain protein  30.82 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5647  Universal stress protein UspA family  32.17 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  32.45 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  31.16 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  34.62 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  28.08 
 
 		 152 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  30.71 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  32.65 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1591  hypothetical protein  30.14 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  32.17 
 
 		 168 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  32.14 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  31.97 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  34.81 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  32.17 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  32.65 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  30.28 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  28.77 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1937  hypothetical protein  35.17 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.163086  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  26.9 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  30.28 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  32.65 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  27.97 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  31.82 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  29.08 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  33.56 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  31.29 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  28.86 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  29.93 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4155  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  28.86 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2436  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236391 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  33.1 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2722  UspA domain protein  27.97 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1525  universal stress family protein  31.29 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  40.3 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  33.1 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  29.76 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1610  universal stress family protein  31.29 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  28.19 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  28.19 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  28.19 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  28.19 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  30.94 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  30.99 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  30.56 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  28.19 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  29.37 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5907  hypothetical protein  32.41 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  31.97 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1966  universal stress protein  33.33 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1892  universal stress protein  33.33 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0327911  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  29.17 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  30.59 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  33.1 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3020  putative universal stress protein Usp  29.37 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.680778  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1924  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.164923 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3822  UspA domain protein  31.21 
 
 		 159 aa  53.9  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  27.1 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5983  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 		 311 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965919 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  33.56 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  33.1 
 
 		 140 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4679  UspA domain protein  32.41 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  32.24 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  33.1 
 
 		 140 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0519  hypothetical protein  32.19 
 
 		 145 aa  52.4  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581709  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  28.39 
 
 		 180 aa  52.4  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  29.45 
 
 		 200 aa  52.4  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  29.94 
 
 		 167 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3786  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 		 311 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5324  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4253  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 		 314 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162019  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>