More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1768 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 140 aa  277  3e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  76.43 
 
 		 140 aa  222  1e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0674  UspA domain-containing protein  44.29 
 
 		 143 aa  101  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  35.77 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  35.46 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  36.91 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  28.77 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  37.59 
 
 		 143 aa  80.1  0.000000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  31.47 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  30 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  30.92 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  34.72 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  36.62 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  31.61 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  31.16 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1272  UspA domain-containing protein  33.58 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.828897 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  33.54 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  33.54 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  36.43 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  29.29 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  28.78 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  29.93 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  28.57 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  29.37 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  36.17 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  34.51 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  31.47 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  30.22 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  27.21 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  33.09 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  30 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  31.94 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  31.76 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  28.67 
 
 		 157 aa  67  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  28.26 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  28.12 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  30.71 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  27.86 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  27.66 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  27.46 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  31.69 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  28.26 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  28.67 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.88 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  28.77 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  27.5 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.93 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  31.69 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  31.47 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  31.29 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  29.17 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  30.43 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  30.43 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  28.67 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  26.57 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03760  universal stress protein UspA-like protein  30.25 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00361063  normal  0.318246 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  29.93 
 
 		 280 aa  63.9  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  24.82 
 
 		 286 aa  63.5  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 		 164 aa  63.5  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  31.13 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  31.47 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  28.06 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  26.32 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  27.82 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  27.01 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  28.38 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  25.17 
 
 		 164 aa  62  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  31.72 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  28.86 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  33.55 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  26.76 
 
 		 143 aa  62  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  31.03 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  33.33 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  25.68 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  31.47 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  29.41 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  27.86 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  32.88 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  25.87 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  24.48 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  26.71 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>