More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2091 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 140 aa  278  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  66.43 
 
 		 140 aa  185  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  55 
 
 		 140 aa  155  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  40 
 
 		 140 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  43.17 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  41.84 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2511  UspA domain-containing protein  42.14 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.947152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  35 
 
 		 154 aa  87.4  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  36.62 
 
 		 148 aa  84.7  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  39.13 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2521  hypothetical protein  38.03 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212811  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  34.06 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  38.41 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  30.71 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  37.86 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  39.72 
 
 		 304 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  37.96 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  34.69 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  35.46 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  33.57 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  35.51 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  30.77 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  34.97 
 
 		 141 aa  72  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  30 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 		 145 aa  72  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  35.21 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  30.82 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  30.66 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  29.5 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0002  UspA domain-containing protein  34.21 
 
 		 201 aa  67.4  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0913  UspA domain-containing protein  38.41 
 
 		 138 aa  67  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.455185 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  29.58 
 
 		 150 aa  67  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  34.19 
 
 		 314 aa  67  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  31.88 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  34.06 
 
 		 136 aa  67  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  28.57 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  29.58 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  29.58 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  33.33 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  36.36 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  29.58 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  36.43 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  29.58 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  29.58 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  29.58 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  32.61 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  35.42 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  32.62 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  30.66 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  29.58 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  29.66 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  32.17 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  28.87 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  28.87 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  32.39 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  36.36 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  34.27 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 162 aa  63.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  34.53 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  32.14 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  34.31 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  36.03 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0806  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0671262  normal  0.592673 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  30.41 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  28.06 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  30.99 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  33.81 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.21 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  32.14 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  30.77 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1531  UspA domain protein  31.88 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00154671  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  35.29 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0340  UspA domain protein  32.5 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  34 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  32.17 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  29.25 
 
 		 276 aa  60.8  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.14 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2708  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 		 277 aa  60.5  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0505017  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  32.14 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2436  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236391 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  35.66 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  32.14 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  30.72 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1740  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0341137  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  36.49 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  30.77 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>