More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1459 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  100 
 
 
147 aa  303  4.0000000000000004e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  42.34 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  44.06 
 
 
142 aa  102  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  40.74 
 
 
138 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  37.16 
 
 
150 aa  90.9  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  35.97 
 
 
142 aa  89.4  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  36.36 
 
 
148 aa  89.4  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  34.87 
 
 
150 aa  89.4  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  37.16 
 
 
143 aa  89  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  35.57 
 
 
147 aa  88.2  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  38.03 
 
 
142 aa  87.4  5e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  35.77 
 
 
143 aa  87.4  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  35.57 
 
 
157 aa  86.7  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 
142 aa  86.7  9e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  38.19 
 
 
138 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  36.84 
 
 
150 aa  85.5  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  35.97 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  41.78 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  34.27 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  36.23 
 
 
141 aa  82.4  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 
161 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  34.04 
 
 
283 aa  80.9  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  32.19 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  35.46 
 
 
180 aa  80.5  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  33.55 
 
 
164 aa  80.5  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  34.21 
 
 
154 aa  80.1  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  35.1 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  41.3 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  35.81 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  34 
 
 
303 aa  79  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  35.51 
 
 
128 aa  79  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  31.88 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  33.33 
 
 
140 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2183  universal stress family protein  35.46 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1841  UspA domain protein  35.46 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  37.59 
 
 
142 aa  77  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
145 aa  76.6  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  34.04 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  34.01 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  31.16 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  36.62 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  32.26 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  35.71 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 
297 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 
137 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  32.19 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  32.43 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 
128 aa  74.3  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  34.78 
 
 
290 aa  73.9  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  34.19 
 
 
162 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  32.35 
 
 
208 aa  73.9  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  38.46 
 
 
296 aa  73.6  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4735  universal stress protein  32.86 
 
 
165 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0233182  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  33.33 
 
 
164 aa  73.6  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2521  hypothetical protein  33.57 
 
 
142 aa  73.6  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212811  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  29.86 
 
 
305 aa  73.6  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1848  UspA family nucleotide-binding protein  36.11 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  30.82 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  33.81 
 
 
162 aa  73.6  0.0000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 
139 aa  73.6  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  31.94 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  31.94 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  31.94 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  31.94 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1574  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  30.41 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  31.94 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  31.94 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1117  hypothetical protein  31.76 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  35.71 
 
 
295 aa  72.8  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  31.94 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1493  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1513  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224479  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1597  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  31.94 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  34.69 
 
 
143 aa  72  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  36.18 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  32.65 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  38.1 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  33.33 
 
 
140 aa  72  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>