More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2620 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  100 
 
 		 143 aa  281  2.0000000000000002e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  69.01 
 
 		 141 aa  202  2e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  52.14 
 
 		 139 aa  142  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  53.42 
 
 		 144 aa  138  3e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  51.05 
 
 		 140 aa  137  3.9999999999999997e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  46.04 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  41.84 
 
 		 137 aa  103  8e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  43.26 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  42.55 
 
 		 137 aa  96.7  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  43.06 
 
 		 143 aa  92.8  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  42.66 
 
 		 128 aa  90.9  5e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  40.56 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  35.21 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  36.55 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  39.46 
 
 		 166 aa  87  7e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  40.27 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  40.27 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  36.3 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  35.17 
 
 		 139 aa  84.3  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 		 138 aa  83.6  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  35.53 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  34.75 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  37.25 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  34.48 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  40.79 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  34.69 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  31.69 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0674  UspA domain-containing protein  36 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  41.26 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  37.59 
 
 		 140 aa  80.1  0.000000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  40.27 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  38.03 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  35.62 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  36.17 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  34.93 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  33.8 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  35.46 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0942  UspA domain protein  34.97 
 
 		 308 aa  78.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0253  UspA domain-containing protein  40.71 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.157205 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  33.56 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  33.1 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  38.51 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  30.77 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  28.76 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  36.11 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  32.39 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  33.57 
 
 		 164 aa  76.6  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  37.33 
 
 		 160 aa  77  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  35.42 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  35.42 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  35.42 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  35.42 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  35.42 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  34.46 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  35.42 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  35.42 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  35.42 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  34.64 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  32.19 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  36.73 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  39.33 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1769  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00594463  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  28.1 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  33.79 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  28.1 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1862  UspA domain protein  35.66 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0496809 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 		 163 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  32.47 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  33.78 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  35.97 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  32.88 
 
 		 164 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 		 162 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  32.43 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  35.42 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  36.91 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  26.8 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  34.21 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  33.77 
 
 		 157 aa  72  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 159 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  32.39 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 153 aa  72  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  38.3 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>