More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2204 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  100 
 
 		 150 aa  304  3e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  70.34 
 
 		 147 aa  214  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  71.03 
 
 		 146 aa  210  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  69.86 
 
 		 149 aa  205  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  68.28 
 
 		 147 aa  202  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  50 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  44.9 
 
 		 151 aa  120  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  41.5 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  43.45 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  40.54 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  41.78 
 
 		 149 aa  103  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  40.13 
 
 		 145 aa  103  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  37.5 
 
 		 145 aa  100  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  41.18 
 
 		 150 aa  100  8e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  39.31 
 
 		 147 aa  98.6  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  40.14 
 
 		 147 aa  97.8  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  38.62 
 
 		 148 aa  96.7  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  36.18 
 
 		 145 aa  96.3  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  39.19 
 
 		 180 aa  92.4  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  38.36 
 
 		 162 aa  89.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  37.16 
 
 		 150 aa  87.8  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  34.16 
 
 		 212 aa  87  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  37.33 
 
 		 147 aa  86.7  9e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  36.24 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  31.79 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 		 162 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  34.64 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  35.71 
 
 		 162 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  35.71 
 
 		 162 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  35.1 
 
 		 162 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  31.08 
 
 		 159 aa  84  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 		 160 aa  84  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  34.44 
 
 		 164 aa  83.6  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  38.19 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  35.14 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  33.99 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  36.36 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  32.67 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  32.67 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  33.77 
 
 		 290 aa  81.3  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  34 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  32 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  38.67 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  32 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  35.51 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  32.88 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  37.06 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  35.21 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  36 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  33.78 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  33.57 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  35.46 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  31.72 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  51.61 
 
 		 217 aa  77.4  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  28.29 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  32.62 
 
 		 320 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  32.43 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  32.67 
 
 		 153 aa  76.6  0.00000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  35.17 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  31.94 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  32.87 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  35.92 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1650  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  30.52 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  29.61 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  33.97 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  34.01 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  34.48 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  37.24 
 
 		 286 aa  75.1  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  33.77 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  33.79 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  35.21 
 
 		 390 aa  74.7  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  35.21 
 
 		 291 aa  74.7  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  34.29 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  36.05 
 
 		 297 aa  75.1  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  35.95 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  35.95 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2501  UspA domain protein  35.46 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432858  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1270  universal stress protein  33.55 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  35.86 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 155 aa  73.6  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  31.79 
 
 		 200 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 		 162 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  57.41 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  37.09 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3456  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  34.27 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>