More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0982 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  100 
 
 
140 aa  288  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  46.9 
 
 
145 aa  131  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  37.32 
 
 
142 aa  87.8  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 
140 aa  87.4  6e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
139 aa  86.3  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  35.86 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  34.72 
 
 
148 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 
138 aa  83.6  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  38.1 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 
140 aa  82  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3480  UspA domain protein  35.81 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  34.01 
 
 
162 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  38.51 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  38.03 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  38.03 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  32.86 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 
141 aa  80.5  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  37.32 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  35.46 
 
 
142 aa  80.1  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  32.17 
 
 
141 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  31.91 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2436  UspA domain-containing protein  38.3 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.236391 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  31.69 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  34.03 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  34.04 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  30.94 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  36.55 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  30.43 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  32.24 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  38.03 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  35.51 
 
 
138 aa  77.4  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  31.25 
 
 
145 aa  77  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  34.93 
 
 
303 aa  77  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 
144 aa  77  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  32.64 
 
 
180 aa  76.6  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  31.88 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  31.33 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  32.86 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  29.66 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  33.33 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  36.49 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  31.33 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  33.33 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  32.14 
 
 
164 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  32.62 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 
128 aa  75.5  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  34.69 
 
 
162 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  32.26 
 
 
167 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  34.69 
 
 
162 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  32.88 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  31.88 
 
 
154 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  33.1 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  33.09 
 
 
295 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 
295 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  34.48 
 
 
295 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 
295 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 
137 aa  73.6  0.0000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  33.33 
 
 
139 aa  73.6  0.0000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  33.99 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  31.47 
 
 
147 aa  73.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  35.33 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  35.46 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  28.86 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  34.06 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  32.24 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  33.11 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  32.62 
 
 
152 aa  72  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  34.01 
 
 
288 aa  72.8  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2210  universal stress protein UspA  31.94 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2826  hypothetical protein  32.39 
 
 
145 aa  72  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0301655  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  33.57 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  36.36 
 
 
289 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  35.42 
 
 
150 aa  72  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 
293 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  33.11 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  34.51 
 
 
153 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  32.24 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  35.42 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2821  hypothetical protein  33.11 
 
 
149 aa  72  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253372  normal  0.0804711 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  34.51 
 
 
153 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3206  UspA domain protein  30.2 
 
 
151 aa  72  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  31.65 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  33.33 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>