More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2815 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  100 
 
 		 147 aa  293  4e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  69.39 
 
 		 147 aa  209  7e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  67.35 
 
 		 147 aa  209  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  67.35 
 
 		 147 aa  209  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  68.71 
 
 		 147 aa  207  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  65.99 
 
 		 147 aa  202  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  66.67 
 
 		 147 aa  199  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  60.27 
 
 		 148 aa  180  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2772  UspA domain-containing protein  57.82 
 
 		 147 aa  166  9e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  54.05 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  42.67 
 
 		 147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  44.59 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  44.59 
 
 		 144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  44.59 
 
 		 144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  44.59 
 
 		 144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  44.59 
 
 		 144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  43.92 
 
 		 144 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  44.59 
 
 		 144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  40.82 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  44.59 
 
 		 144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  44.59 
 
 		 144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1233  UspA domain protein  42.57 
 
 		 144 aa  110  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1299  UspA domain protein  42.57 
 
 		 144 aa  110  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0196706  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  43.92 
 
 		 144 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  43.92 
 
 		 144 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  43.92 
 
 		 144 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  42.57 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  41.22 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  42.57 
 
 		 168 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  41.22 
 
 		 144 aa  107  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  47.62 
 
 		 171 aa  106  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2487  UspA domain protein  40.54 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0465125  hitchhiker  0.000264577 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  40.54 
 
 		 144 aa  104  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  43.92 
 
 		 147 aa  104  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  40.82 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  43.24 
 
 		 144 aa  100  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  42.18 
 
 		 144 aa  100  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2068  UspA domain-containing protein  44.59 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960208  normal  0.914393 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6028  hypothetical protein  44.59 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.999121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2049  UspA domain-containing protein  44.59 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765605  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1892  universal stress protein  40.94 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0327911  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1966  universal stress protein  40.94 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  40.82 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  40 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  40.82 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  39.46 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_003296  RS05426  hypothetical protein  35.14 
 
 		 146 aa  93.2  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  38 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  40.82 
 
 		 180 aa  92  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4983  hypothetical protein  36.67 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4213  UspA domain protein  34.46 
 
 		 146 aa  90.9  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  38.1 
 
 		 145 aa  90.5  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4323  UspA domain protein  34.46 
 
 		 146 aa  90.9  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.729204  normal  0.0224521 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  39.86 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4660  putative universal stress protein (Usp)  40.13 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.969367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3206  UspA domain protein  42.18 
 
 		 151 aa  88.6  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1541  hypothetical protein  37.06 
 
 		 181 aa  89  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  43.14 
 
 		 146 aa  87  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1352  UspA domain protein  43.33 
 
 		 146 aa  87  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.012903 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  38.1 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 		 158 aa  83.6  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1055  universal stress protein  33.78 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0994  universal stress protein  33.78 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  38.82 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  37.75 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  34.9 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3875  hypothetical protein  39.46 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  39.33 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  37.09 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  36.18 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  34.9 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  36.73 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  37.16 
 
 		 290 aa  80.5  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  40.91 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  34.46 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  38.82 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  36.67 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  35.1 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  35.33 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  33.11 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  37.24 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  33.77 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  35.81 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  34.39 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  32.88 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  33.78 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  33.12 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  33.78 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  33.78 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  33.78 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  33.78 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>