More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1206 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  306  9e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  82.55 
 
 		 164 aa  248  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  56.08 
 
 		 173 aa  167  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  57.24 
 
 		 155 aa  152  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  52.98 
 
 		 155 aa  152  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  49.01 
 
 		 169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  44.83 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  42.76 
 
 		 154 aa  124  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3456  UspA domain-containing protein  44.83 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  43.71 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  37.42 
 
 		 156 aa  100  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  42.21 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  38.93 
 
 		 157 aa  98.6  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  39.49 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  40.14 
 
 		 161 aa  96.7  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1761  hypothetical protein  38.78 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  41.67 
 
 		 200 aa  95.5  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  39.74 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  37.01 
 
 		 156 aa  95.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  39.74 
 
 		 151 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 		 142 aa  94.4  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  41.03 
 
 		 164 aa  94.4  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  39.74 
 
 		 151 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  42.86 
 
 		 155 aa  94  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  39.74 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  39.74 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  37.84 
 
 		 156 aa  90.9  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  41.61 
 
 		 166 aa  90.5  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  41.61 
 
 		 166 aa  90.5  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  40.79 
 
 		 151 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  40.79 
 
 		 151 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  40.52 
 
 		 152 aa  89.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  38.62 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  35.33 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  41.61 
 
 		 166 aa  88.6  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  39.6 
 
 		 163 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  39.58 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  38.67 
 
 		 155 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  38.67 
 
 		 155 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  36 
 
 		 151 aa  88.2  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  37.82 
 
 		 162 aa  88.2  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  38.67 
 
 		 155 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  38.67 
 
 		 155 aa  88.2  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  38.67 
 
 		 155 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  40 
 
 		 155 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  40.27 
 
 		 163 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  38.93 
 
 		 167 aa  87.8  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  38.51 
 
 		 147 aa  87.8  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  39.07 
 
 		 145 aa  87.8  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  38.51 
 
 		 147 aa  87.8  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  41.03 
 
 		 200 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  41.03 
 
 		 156 aa  87.4  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  41.03 
 
 		 156 aa  87.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  41.03 
 
 		 156 aa  87.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  41.03 
 
 		 156 aa  87.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  41.03 
 
 		 156 aa  87.4  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1760  hypothetical protein  36.36 
 
 		 148 aa  87  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  37.97 
 
 		 157 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  37.75 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  34.44 
 
 		 150 aa  86.7  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  38.41 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  39.87 
 
 		 159 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  38 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  34.44 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  36.73 
 
 		 151 aa  84.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  35.33 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  40.13 
 
 		 157 aa  84  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  38.56 
 
 		 145 aa  84  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  38.36 
 
 		 155 aa  84  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  39.73 
 
 		 143 aa  84  8e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 		 152 aa  83.6  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  37.67 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 		 155 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  36.99 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  39.07 
 
 		 155 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  38.36 
 
 		 155 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  37.42 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  36.3 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 		 155 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  35.14 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  33.11 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  37.16 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  37.91 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  37.91 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  37.91 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  36.18 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  36.18 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  36.18 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  36.18 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  36.18 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  39.6 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  36.18 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  36.18 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  36.18 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  36.49 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  36 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>