More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1311 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  100 
 
 
187 aa  377  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  83.33 
 
 
154 aa  258  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3456  UspA domain-containing protein  72.11 
 
 
164 aa  213  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198744  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  48.37 
 
 
173 aa  156  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  46.21 
 
 
164 aa  137  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  44.83 
 
 
154 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  41.1 
 
 
155 aa  115  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  41.78 
 
 
155 aa  111  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  40.67 
 
 
151 aa  105  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  37.58 
 
 
151 aa  102  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1761  hypothetical protein  38.93 
 
 
150 aa  98.6  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  35.62 
 
 
169 aa  97.1  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  40.79 
 
 
151 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  40.79 
 
 
151 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1760  hypothetical protein  38.67 
 
 
148 aa  95.5  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  34.18 
 
 
157 aa  94  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  39.47 
 
 
151 aa  93.6  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  37.04 
 
 
156 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  38.16 
 
 
156 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6198  UspA domain-containing protein  38.93 
 
 
156 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.53809 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  36.94 
 
 
151 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4281  UspA domain-containing protein  40.27 
 
 
156 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0794331 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  36.94 
 
 
151 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  36.81 
 
 
165 aa  92.8  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  38 
 
 
157 aa  92.4  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3813  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 
156 aa  92.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.175974  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  40.38 
 
 
159 aa  91.3  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  41.1 
 
 
155 aa  91.3  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  39.19 
 
 
151 aa  90.9  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  38.26 
 
 
156 aa  89.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  36.42 
 
 
150 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  39.86 
 
 
168 aa  89  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  39.46 
 
 
155 aa  88.6  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
147 aa  88.6  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  36.13 
 
 
155 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  38.36 
 
 
144 aa  87.4  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  37.5 
 
 
187 aa  87.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5869  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 
148 aa  87  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135871  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  37.01 
 
 
156 aa  87  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  35.8 
 
 
157 aa  87  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  37.66 
 
 
158 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  39.04 
 
 
155 aa  86.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  39.73 
 
 
155 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  39.73 
 
 
155 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  39.73 
 
 
155 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  36.99 
 
 
155 aa  85.5  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  39.31 
 
 
148 aa  85.5  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  37.67 
 
 
155 aa  85.5  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 
147 aa  85.5  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  38.06 
 
 
155 aa  85.5  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  32.89 
 
 
147 aa  85.5  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  36.99 
 
 
155 aa  85.1  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  36.99 
 
 
155 aa  85.1  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  36.99 
 
 
155 aa  85.1  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  36.77 
 
 
155 aa  85.1  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  36.99 
 
 
155 aa  85.1  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  36.91 
 
 
151 aa  85.1  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  39.73 
 
 
158 aa  84.7  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
153 aa  84.3  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  36 
 
 
151 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  39.07 
 
 
152 aa  84  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 
158 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  34.84 
 
 
152 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  38.67 
 
 
163 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  33.77 
 
 
161 aa  84  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  37.18 
 
 
156 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  34.25 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  33.79 
 
 
149 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5901  UspA domain-containing protein  36 
 
 
155 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.475966  normal  0.0916735 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  37.21 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  34.62 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  38.1 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  32.7 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4708  hypothetical protein  37.18 
 
 
147 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 
157 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  36.42 
 
 
164 aa  82  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  38 
 
 
167 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  34 
 
 
147 aa  82  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  33.96 
 
 
154 aa  82  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  35.9 
 
 
280 aa  82  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  33.33 
 
 
157 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  34.94 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  36.73 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  38 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  36 
 
 
151 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  35.42 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  36 
 
 
151 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  33.76 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  35.9 
 
 
149 aa  80.1  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1966  universal stress protein  31.13 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  32.45 
 
 
150 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  34.19 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1136  UspA domain-containing protein  35.29 
 
 
148 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 
325 aa  80.1  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1892  universal stress protein  31.13 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0327911  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  39.04 
 
 
390 aa  79.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0641  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 
314 aa  79.3  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
162 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  33.33 
 
 
166 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>