More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3815 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 167 aa  329  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  93.41 
 
 		 163 aa  293  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  89.22 
 
 		 163 aa  277  6e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  84.43 
 
 		 167 aa  259  8e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  67.31 
 
 		 164 aa  200  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  59.39 
 
 		 167 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  66.67 
 
 		 164 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  66.67 
 
 		 164 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  66.67 
 
 		 164 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  66.67 
 
 		 164 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  66.67 
 
 		 164 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  66.67 
 
 		 164 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  57.33 
 
 		 187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  54.76 
 
 		 168 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  55.03 
 
 		 168 aa  157  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  52.74 
 
 		 155 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  51.7 
 
 		 155 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  52.74 
 
 		 155 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  52.74 
 
 		 155 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  51.7 
 
 		 155 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  51.7 
 
 		 156 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  49.66 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  49.66 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  49.66 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  49.66 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  49.66 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  49.66 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  49.66 
 
 		 155 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  47.62 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  47.4 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  48.97 
 
 		 200 aa  131  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  47.95 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  49.66 
 
 		 200 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  49.66 
 
 		 156 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  49.66 
 
 		 156 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  49.66 
 
 		 156 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  49.66 
 
 		 156 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  49.66 
 
 		 156 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  46 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  47.95 
 
 		 153 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  48.32 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  48.32 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  46.21 
 
 		 152 aa  120  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  42.76 
 
 		 159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  42.76 
 
 		 157 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  42.76 
 
 		 159 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  42.5 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  44.31 
 
 		 165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  44.83 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  42.07 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  42.07 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  42.07 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  42.67 
 
 		 156 aa  111  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  43.06 
 
 		 156 aa  108  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  41.88 
 
 		 157 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  41.33 
 
 		 151 aa  107  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  41.33 
 
 		 151 aa  107  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  42.76 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  42 
 
 		 151 aa  105  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  40 
 
 		 151 aa  98.6  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  40.14 
 
 		 166 aa  97.4  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  41.33 
 
 		 184 aa  96.3  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  37.04 
 
 		 166 aa  95.5  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  39.46 
 
 		 155 aa  95.5  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  37.04 
 
 		 166 aa  95.5  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  39.74 
 
 		 155 aa  94.7  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  34.87 
 
 		 150 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  39.33 
 
 		 151 aa  92  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  36.24 
 
 		 151 aa  91.3  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  42.95 
 
 		 151 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  42.95 
 
 		 151 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1230  universal stress family protein  41.78 
 
 		 201 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296096  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2428  universal stress protein  41.78 
 
 		 191 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1156  universal stress family protein  41.78 
 
 		 201 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  37.75 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  38.93 
 
 		 154 aa  89  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0705  universal stress protein  42.86 
 
 		 152 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.284573  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1723  universal stress protein  42.86 
 
 		 152 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  37.41 
 
 		 158 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0758  universal stress protein  42.86 
 
 		 152 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  39.6 
 
 		 169 aa  88.2  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  37.93 
 
 		 153 aa  88.2  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  36.94 
 
 		 149 aa  88.2  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1569  universal stress protein  42.86 
 
 		 152 aa  87.4  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5820  UspA domain-containing protein  45.07 
 
 		 318 aa  87.4  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131616 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  38.78 
 
 		 157 aa  87.4  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  39.6 
 
 		 151 aa  87  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  36.55 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  36.55 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  35.06 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  39.22 
 
 		 153 aa  86.3  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  36.88 
 
 		 156 aa  85.9  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  37.33 
 
 		 154 aa  85.1  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4281  UspA domain-containing protein  43.75 
 
 		 156 aa  85.1  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0794331 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  38.78 
 
 		 155 aa  84.7  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  39.31 
 
 		 144 aa  84.3  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  34.19 
 
 		 155 aa  83.6  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5869  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  37.09 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  33.77 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>