More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2829 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  100 
 
 		 169 aa  333  5e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  54.49 
 
 		 173 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  48.05 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  49.01 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  47.62 
 
 		 164 aa  139  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  49.36 
 
 		 155 aa  137  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  43.62 
 
 		 151 aa  112  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  46.71 
 
 		 155 aa  105  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3456  UspA domain-containing protein  38.96 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  40.4 
 
 		 151 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  40.4 
 
 		 151 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  42.38 
 
 		 151 aa  99.8  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  38.31 
 
 		 157 aa  99.8  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  42.57 
 
 		 161 aa  98.2  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  41.22 
 
 		 164 aa  97.4  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  36.99 
 
 		 154 aa  96.7  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  35.62 
 
 		 187 aa  97.1  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  38.75 
 
 		 200 aa  96.3  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  37.72 
 
 		 187 aa  96.3  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  37.66 
 
 		 156 aa  94.7  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  37.42 
 
 		 156 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 		 142 aa  92.4  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  39.46 
 
 		 158 aa  91.7  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  39.6 
 
 		 151 aa  92  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  39.6 
 
 		 151 aa  92  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  36.02 
 
 		 157 aa  91.7  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  40.27 
 
 		 168 aa  91.7  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  35.57 
 
 		 151 aa  90.1  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  39.38 
 
 		 200 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  39.38 
 
 		 156 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1760  hypothetical protein  36.42 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  39.38 
 
 		 156 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  39.38 
 
 		 156 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  39.38 
 
 		 156 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  39.38 
 
 		 156 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  39.33 
 
 		 150 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 		 163 aa  89  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  38.51 
 
 		 155 aa  89  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  35.71 
 
 		 146 aa  88.6  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  36.71 
 
 		 151 aa  88.6  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  39.46 
 
 		 163 aa  88.2  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  36.13 
 
 		 157 aa  88.2  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  37.8 
 
 		 164 aa  88.2  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  35.76 
 
 		 162 aa  87.8  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  39.6 
 
 		 167 aa  87.8  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  36.49 
 
 		 155 aa  87.4  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  37.67 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  36.25 
 
 		 155 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  36.25 
 
 		 155 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  36.25 
 
 		 155 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  36.25 
 
 		 155 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  36.25 
 
 		 155 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  36.99 
 
 		 147 aa  85.9  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  37.34 
 
 		 152 aa  85.9  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  34.9 
 
 		 145 aa  85.1  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 		 155 aa  84.7  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  36.25 
 
 		 155 aa  84.7  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  36.54 
 
 		 156 aa  84.7  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  39.47 
 
 		 156 aa  84.3  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  37.75 
 
 		 153 aa  84.3  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  38.16 
 
 		 151 aa  84.3  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  36.77 
 
 		 156 aa  84.3  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1761  hypothetical protein  35.95 
 
 		 150 aa  84.3  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  39.47 
 
 		 153 aa  84.3  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  39.87 
 
 		 155 aa  84.3  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  36.91 
 
 		 151 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  40.37 
 
 		 167 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  34.9 
 
 		 154 aa  83.6  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  33.13 
 
 		 159 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  36.91 
 
 		 151 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  39.46 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  32.52 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  40 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  38.41 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  40 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  36.77 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  39.13 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  36.36 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  41.36 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5869  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 148 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  33.77 
 
 		 157 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1650  universal stress protein  37.82 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262714  normal  0.111079 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  32.89 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  32.43 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  34 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4708  hypothetical protein  39.6 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  33.33 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  36.71 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  34.81 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5987  UspA domain-containing protein  37.18 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  37.18 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  37.18 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>