More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4869 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  100 
 
 		 151 aa  302  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  100 
 
 		 151 aa  302  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  79.47 
 
 		 151 aa  244  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  48.67 
 
 		 156 aa  155  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  50 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  51.02 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  51.7 
 
 		 200 aa  147  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  50.33 
 
 		 159 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  50.33 
 
 		 159 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  49.66 
 
 		 157 aa  140  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  48.3 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  47.62 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  51.7 
 
 		 200 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  47.62 
 
 		 162 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  45.52 
 
 		 187 aa  137  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  51.7 
 
 		 156 aa  137  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  51.7 
 
 		 156 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  51.7 
 
 		 156 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  51.7 
 
 		 156 aa  137  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  51.7 
 
 		 156 aa  137  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  48.98 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  48.28 
 
 		 168 aa  136  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  48.98 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  48.98 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  44.14 
 
 		 168 aa  131  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  46.67 
 
 		 157 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  46.58 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  43.45 
 
 		 158 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  47.33 
 
 		 150 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  44.67 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  43.45 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  43.42 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  43.45 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  42.07 
 
 		 155 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  42.07 
 
 		 155 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  42.07 
 
 		 155 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  38.36 
 
 		 151 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  40.69 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  45.45 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  45.45 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  45.45 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  45.45 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  45.45 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  41.38 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  41.22 
 
 		 184 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  45.45 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  40 
 
 		 155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  40.14 
 
 		 157 aa  113  7.999999999999999e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  40.82 
 
 		 157 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 		 157 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  42.67 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  38.67 
 
 		 155 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  39.31 
 
 		 155 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  39.31 
 
 		 155 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  39.31 
 
 		 155 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  39.31 
 
 		 155 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  39.31 
 
 		 155 aa  110  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  37.75 
 
 		 151 aa  110  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  40.79 
 
 		 161 aa  110  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  40.41 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  40.41 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5820  UspA domain-containing protein  43.84 
 
 		 318 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131616 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  44.87 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  38.62 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  44.87 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  39.07 
 
 		 153 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  41.33 
 
 		 167 aa  107  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_003296  RS05449  hypothetical protein  37.09 
 
 		 155 aa  107  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504029  normal  0.0915298 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  40.69 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  40.41 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  39.73 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  39.73 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1156  universal stress family protein  41.22 
 
 		 201 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  39.61 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 163 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2428  universal stress protein  41.22 
 
 		 191 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1230  universal stress family protein  41.22 
 
 		 201 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296096  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  42.11 
 
 		 155 aa  101  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0705  universal stress protein  41.22 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.284573  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1723  universal stress protein  41.22 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0758  universal stress protein  41.22 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1569  universal stress protein  39.19 
 
 		 152 aa  100  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3456  UspA domain-containing protein  38.82 
 
 		 164 aa  100  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  40.4 
 
 		 169 aa  100  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  39.86 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  37.67 
 
 		 151 aa  97.8  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  40.69 
 
 		 167 aa  97.1  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  39.33 
 
 		 173 aa  95.5  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5869  UspA domain-containing protein  40.27 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4708  hypothetical protein  39.73 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5987  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 		 156 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  39.74 
 
 		 154 aa  94.4  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  39.86 
 
 		 156 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3776  UspA domain-containing protein  41.22 
 
 		 157 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142255  normal  0.186417 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 		 156 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4254  UspA domain-containing protein  40.54 
 
 		 169 aa  94  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.462473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  36.73 
 
 		 164 aa  94  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4250  UspA domain-containing protein  41.22 
 
 		 157 aa  94  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216245  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>