More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1859 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  100 
 
 
157 aa  313  7e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  76.87 
 
 
152 aa  235  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  54.11 
 
 
156 aa  157  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  54.11 
 
 
156 aa  156  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  52.29 
 
 
200 aa  153  8e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  51.63 
 
 
156 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  51.63 
 
 
156 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  51.63 
 
 
156 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  51.63 
 
 
156 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  51.63 
 
 
156 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  51.63 
 
 
200 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  52.74 
 
 
159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  52.74 
 
 
159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  52.74 
 
 
159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  50 
 
 
153 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  50.32 
 
 
159 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  50.32 
 
 
159 aa  140  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  52.05 
 
 
157 aa  140  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  50 
 
 
162 aa  140  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  52.05 
 
 
184 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  47.95 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  48.65 
 
 
157 aa  132  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  48 
 
 
151 aa  130  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  46.67 
 
 
151 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  46.67 
 
 
151 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  48 
 
 
165 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  50.68 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  47.59 
 
 
187 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  46.21 
 
 
163 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  45.52 
 
 
163 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  46.21 
 
 
168 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  44.83 
 
 
167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  44.97 
 
 
168 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  50 
 
 
164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  50 
 
 
164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  50 
 
 
164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  50 
 
 
164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  50 
 
 
164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  50 
 
 
164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  47.59 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  41.5 
 
 
156 aa  111  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  43.45 
 
 
156 aa  111  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  40.13 
 
 
155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  40.13 
 
 
155 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  42.47 
 
 
155 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  40.13 
 
 
155 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  39.47 
 
 
155 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 
150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  42.47 
 
 
155 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  42.47 
 
 
155 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  42.07 
 
 
167 aa  107  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  43.15 
 
 
158 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  39.6 
 
 
158 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  40.26 
 
 
156 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  39.47 
 
 
155 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  39.47 
 
 
155 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  39.47 
 
 
155 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  39.47 
 
 
155 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  40.13 
 
 
155 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  40.27 
 
 
155 aa  103  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  38.96 
 
 
155 aa  102  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  41.33 
 
 
158 aa  100  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  40.54 
 
 
155 aa  100  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  41.06 
 
 
151 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  41.06 
 
 
151 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  39.33 
 
 
155 aa  94  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  36.49 
 
 
151 aa  93.6  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5869  UspA domain-containing protein  37.42 
 
 
148 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135871  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  33.77 
 
 
151 aa  92  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  39.38 
 
 
155 aa  91.3  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  39.61 
 
 
166 aa  91.7  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  39.61 
 
 
166 aa  91.7  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1890  putative universal stress protein, UspA-like  41.55 
 
 
317 aa  90.9  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508321  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3776  UspA domain-containing protein  38.99 
 
 
157 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142255  normal  0.186417 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1761  hypothetical protein  38.82 
 
 
150 aa  89  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4250  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 
157 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216245  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  36.18 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5987  UspA domain-containing protein  40.52 
 
 
156 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  40.52 
 
 
156 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  40.52 
 
 
156 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4254  UspA domain-containing protein  39.33 
 
 
169 aa  87.8  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.462473  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5820  UspA domain-containing protein  41.13 
 
 
318 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.131616 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1136  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 
148 aa  87.8  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  37.84 
 
 
143 aa  87  8e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  33.96 
 
 
154 aa  86.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  38.36 
 
 
166 aa  86.3  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1569  universal stress protein  36.67 
 
 
152 aa  86.3  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1102  UspA domain-containing protein  40.82 
 
 
319 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4281  UspA domain-containing protein  40.79 
 
 
156 aa  85.5  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0794331 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1650  universal stress protein  39.19 
 
 
156 aa  84.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262714  normal  0.111079 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1760  hypothetical protein  34.44 
 
 
148 aa  84.3  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  33.56 
 
 
151 aa  84  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  35.62 
 
 
157 aa  84  8e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2428  universal stress protein  37.33 
 
 
191 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3813  UspA domain-containing protein  39.74 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.175974  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0758  universal stress protein  37.33 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0705  universal stress protein  37.33 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.284573  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1156  universal stress family protein  37.33 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1230  universal stress family protein  37.84 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296096  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1723  universal stress protein  37.33 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>