More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2306 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 155 aa  303  7e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  71.43 
 
 		 155 aa  219  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  49.66 
 
 		 173 aa  152  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  52.98 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  48.05 
 
 		 169 aa  149  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  50.66 
 
 		 164 aa  142  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3456  UspA domain-containing protein  42.67 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  41.33 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  40.54 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  41.1 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  44.9 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  44.59 
 
 		 168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  38.82 
 
 		 200 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  41.45 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  36.6 
 
 		 156 aa  103  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  42.68 
 
 		 164 aa  102  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  39.24 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1761  hypothetical protein  40.52 
 
 		 150 aa  100  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  40.54 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  38.16 
 
 		 200 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  40.82 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  38.16 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  38.16 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  38.16 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  38.16 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  38.16 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  38.26 
 
 		 152 aa  97.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1760  hypothetical protein  38.82 
 
 		 148 aa  97.4  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  38.16 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  41.89 
 
 		 158 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  39.19 
 
 		 144 aa  95.5  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  39.46 
 
 		 167 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  36.94 
 
 		 159 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 		 163 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  38.51 
 
 		 155 aa  93.6  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  37.84 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  39.61 
 
 		 151 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  39.61 
 
 		 151 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  37.84 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  40.54 
 
 		 167 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  38.78 
 
 		 163 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  36.31 
 
 		 159 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  37.16 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  42 
 
 		 155 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  39.38 
 
 		 157 aa  91.3  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  40.65 
 
 		 164 aa  90.9  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3813  UspA domain-containing protein  39.74 
 
 		 156 aa  90.9  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.175974  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5987  UspA domain-containing protein  38.96 
 
 		 156 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  36.73 
 
 		 145 aa  90.1  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  41.33 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  41.33 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  40.4 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  41.33 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  38 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  41.33 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  41.33 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  40.4 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  38 
 
 		 156 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  40.4 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  41.72 
 
 		 166 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  37.5 
 
 		 290 aa  89  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  41.72 
 
 		 166 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  41.33 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  37.25 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4281  UspA domain-containing protein  41.18 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0794331 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  37.25 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1136  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  37.25 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1650  universal stress protein  39.35 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262714  normal  0.111079 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  38.22 
 
 		 157 aa  87.8  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  39.46 
 
 		 167 aa  87.8  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  40.91 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  38.31 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  38.31 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  34.9 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  39.51 
 
 		 162 aa  85.5  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  34.67 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  37.09 
 
 		 184 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  37.33 
 
 		 158 aa  84.7  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6198  UspA domain-containing protein  39.19 
 
 		 156 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.53809 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  35.81 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  37.5 
 
 		 155 aa  85.1  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  36.71 
 
 		 161 aa  84.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  36.77 
 
 		 148 aa  84  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5901  UspA domain-containing protein  37.82 
 
 		 155 aa  84  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.475966  normal  0.0916735 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4250  UspA domain-containing protein  38.96 
 
 		 157 aa  84  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4708  hypothetical protein  39.24 
 
 		 147 aa  84  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  35.1 
 
 		 149 aa  84  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  39.74 
 
 		 166 aa  83.6  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  34 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  41.22 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_004310  BR1966  universal stress protein  37.09 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5869  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  35.03 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1892  universal stress protein  37.09 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0327911  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3776  UspA domain-containing protein  38.31 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142255  normal  0.186417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>