More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5899 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  100 
 
 
167 aa  333  5e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  84.43 
 
 
167 aa  263  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  84.43 
 
 
163 aa  258  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  82.63 
 
 
163 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  70.51 
 
 
164 aa  209  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  60.61 
 
 
167 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  68.59 
 
 
164 aa  184  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  68.59 
 
 
164 aa  184  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  68.59 
 
 
164 aa  184  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  68.59 
 
 
164 aa  184  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  68.59 
 
 
164 aa  184  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  68.59 
 
 
164 aa  184  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  57.14 
 
 
168 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  52.05 
 
 
187 aa  167  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  57.05 
 
 
168 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  48.72 
 
 
155 aa  144  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  53.42 
 
 
155 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  53.42 
 
 
155 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  53.42 
 
 
155 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  50.64 
 
 
156 aa  142  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  49.66 
 
 
155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  49.66 
 
 
155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  49.66 
 
 
155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  49.66 
 
 
155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  49.66 
 
 
155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  52.03 
 
 
155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  48.08 
 
 
155 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  49.66 
 
 
155 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  51.35 
 
 
155 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  49.66 
 
 
155 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  46.98 
 
 
158 aa  133  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  48.63 
 
 
158 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  46.21 
 
 
200 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  45.89 
 
 
156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  44.97 
 
 
156 aa  124  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  45.7 
 
 
152 aa  124  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  45.91 
 
 
157 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  44.97 
 
 
153 aa  121  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  45.52 
 
 
200 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  45.52 
 
 
156 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  45.52 
 
 
156 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  45.52 
 
 
156 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  45.52 
 
 
156 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  45.52 
 
 
156 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  45.03 
 
 
156 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  46 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  42.24 
 
 
162 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  44.31 
 
 
165 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  41.14 
 
 
159 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  42.07 
 
 
157 aa  114  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  41.14 
 
 
159 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  44.3 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  43.04 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  44.22 
 
 
166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  41.38 
 
 
159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  41.38 
 
 
159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  41.38 
 
 
159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  40.69 
 
 
151 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  40.69 
 
 
151 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  43.45 
 
 
184 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  42.07 
 
 
151 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  39.49 
 
 
166 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  39.49 
 
 
166 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  41.38 
 
 
151 aa  101  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  39.46 
 
 
155 aa  99  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  42.48 
 
 
151 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  42.48 
 
 
151 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  38.62 
 
 
151 aa  94.7  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  41.61 
 
 
151 aa  93.6  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  39.74 
 
 
155 aa  93.6  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 
150 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  37.09 
 
 
151 aa  92.4  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  40.37 
 
 
169 aa  92  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  37.41 
 
 
151 aa  89.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  37.41 
 
 
151 aa  89.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  37.33 
 
 
149 aa  89.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  39.87 
 
 
145 aa  89.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2428  universal stress protein  42.47 
 
 
191 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  40.82 
 
 
158 aa  88.6  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  39.6 
 
 
154 aa  88.2  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5820  UspA domain-containing protein  45.52 
 
 
318 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.131616 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1230  universal stress family protein  42.47 
 
 
201 aa  87.8  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296096  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1156  universal stress family protein  42.47 
 
 
201 aa  87.8  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  42.95 
 
 
162 aa  87.8  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  39.24 
 
 
156 aa  87.8  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0705  universal stress protein  43.54 
 
 
152 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.284573  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  40 
 
 
173 aa  86.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0758  universal stress protein  43.54 
 
 
152 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1723  universal stress protein  43.54 
 
 
152 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  35.06 
 
 
147 aa  86.3  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  40.27 
 
 
145 aa  86.3  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  39.47 
 
 
145 aa  86.3  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  37.42 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  35.86 
 
 
164 aa  85.5  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4281  UspA domain-containing protein  42.67 
 
 
156 aa  85.1  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0794331 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  40.41 
 
 
144 aa  85.1  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  40.41 
 
 
151 aa  84.7  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  39.46 
 
 
155 aa  84.7  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  38.36 
 
 
146 aa  84.3  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  36 
 
 
145 aa  84  8e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>