More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4434 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  100 
 
 
158 aa  318  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  73.68 
 
 
155 aa  235  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  73.68 
 
 
155 aa  234  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  60.81 
 
 
155 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  60.81 
 
 
155 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  60.14 
 
 
155 aa  194  6e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  60.14 
 
 
155 aa  194  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  60.14 
 
 
155 aa  194  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  60.14 
 
 
155 aa  194  6e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  60.14 
 
 
155 aa  193  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  59.09 
 
 
155 aa  192  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  58.97 
 
 
155 aa  192  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  59.6 
 
 
156 aa  191  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  58.62 
 
 
158 aa  184  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  58.62 
 
 
155 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  58.62 
 
 
155 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  58.62 
 
 
155 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  49.66 
 
 
187 aa  147  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  47.53 
 
 
168 aa  144  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  50.34 
 
 
168 aa  138  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  49.32 
 
 
163 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  47.26 
 
 
167 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  47.62 
 
 
167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  47.95 
 
 
163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  43.45 
 
 
151 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  43.45 
 
 
151 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  47.62 
 
 
164 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  44.83 
 
 
153 aa  122  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  42.07 
 
 
151 aa  120  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  46.98 
 
 
167 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  43.45 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  45.14 
 
 
156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  45.14 
 
 
156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  42.76 
 
 
156 aa  117  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  42.24 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  47.74 
 
 
164 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  47.74 
 
 
164 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  47.74 
 
 
164 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  47.74 
 
 
164 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  47.74 
 
 
164 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  47.74 
 
 
164 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  44.14 
 
 
166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  44.14 
 
 
166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  41.38 
 
 
152 aa  107  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  40.67 
 
 
151 aa  107  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  39.6 
 
 
157 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  44.14 
 
 
166 aa  105  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  38.62 
 
 
200 aa  104  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  43.62 
 
 
165 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  36.73 
 
 
151 aa  100  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  42.76 
 
 
184 aa  100  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  37.93 
 
 
151 aa  99.8  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  38.85 
 
 
151 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  36.48 
 
 
159 aa  97.4  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  37.93 
 
 
157 aa  96.3  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  36.6 
 
 
157 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  38.16 
 
 
155 aa  95.9  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  37.93 
 
 
156 aa  95.5  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  37.93 
 
 
156 aa  95.5  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  37.93 
 
 
156 aa  95.5  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  37.93 
 
 
156 aa  95.5  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  37.93 
 
 
200 aa  95.5  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  37.93 
 
 
156 aa  95.5  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  36.73 
 
 
151 aa  95.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  38.93 
 
 
150 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  36.73 
 
 
151 aa  95.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  35.22 
 
 
159 aa  94.7  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 
157 aa  94.4  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 
159 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  37.24 
 
 
159 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 
159 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1569  universal stress protein  38.62 
 
 
152 aa  90.9  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 
147 aa  90.5  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5901  UspA domain-containing protein  40.26 
 
 
155 aa  90.5  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.475966  normal  0.0916735 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4254  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 
169 aa  90.1  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.462473  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6198  UspA domain-containing protein  40.65 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.53809 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  37.74 
 
 
151 aa  89  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  40.4 
 
 
151 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  38.1 
 
 
147 aa  88.6  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  40.4 
 
 
151 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4281  UspA domain-containing protein  41.25 
 
 
156 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0794331 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  36.99 
 
 
154 aa  87.4  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  35.4 
 
 
156 aa  87.4  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1156  universal stress family protein  37.24 
 
 
201 aa  87  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2428  universal stress protein  37.24 
 
 
191 aa  87  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1230  universal stress family protein  37.24 
 
 
201 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296096  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  41.18 
 
 
155 aa  87  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  37.66 
 
 
187 aa  86.3  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0705  universal stress protein  36.55 
 
 
152 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.284573  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  34.01 
 
 
153 aa  85.5  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1723  universal stress protein  36.55 
 
 
152 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5987  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0758  universal stress protein  36.55 
 
 
152 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  36.24 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  38.51 
 
 
290 aa  85.9  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3813  UspA domain-containing protein  39.74 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.175974  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5869  UspA domain-containing protein  38.31 
 
 
148 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135871  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  36.99 
 
 
158 aa  85.5  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  37.58 
 
 
180 aa  84.7  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>