More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6185 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  100 
 
 
157 aa  314  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  89.81 
 
 
157 aa  286  9e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  59.46 
 
 
162 aa  183  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  55.7 
 
 
159 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  55.7 
 
 
159 aa  176  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  56.46 
 
 
159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  57.14 
 
 
157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  56.46 
 
 
159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  56.46 
 
 
159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  51.32 
 
 
200 aa  154  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  48.03 
 
 
156 aa  147  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  48.32 
 
 
156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  50.68 
 
 
152 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  50 
 
 
156 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  50 
 
 
156 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  50 
 
 
156 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  50 
 
 
156 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  50 
 
 
156 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  50 
 
 
200 aa  140  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  49.66 
 
 
153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  47.95 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  45.27 
 
 
150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  46.58 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  43.45 
 
 
168 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  43.83 
 
 
165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  42.41 
 
 
168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  40.82 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  40.82 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  41.5 
 
 
151 aa  111  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  40.51 
 
 
187 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  44.74 
 
 
167 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  43.45 
 
 
163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  42.95 
 
 
163 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  42.07 
 
 
167 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  42.86 
 
 
156 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  41.78 
 
 
156 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  44.52 
 
 
184 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  45.52 
 
 
164 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  45.52 
 
 
164 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  45.52 
 
 
164 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  45.52 
 
 
164 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  45.52 
 
 
164 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  45.52 
 
 
164 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  38.19 
 
 
155 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  38.19 
 
 
155 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  38.19 
 
 
155 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  38.19 
 
 
155 aa  101  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  44.3 
 
 
167 aa  101  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  36.81 
 
 
155 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  39.58 
 
 
155 aa  99.4  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  41.94 
 
 
164 aa  99  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
155 aa  97.4  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
156 aa  97.8  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  38.26 
 
 
151 aa  97.4  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  38.26 
 
 
151 aa  97.4  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 
158 aa  96.7  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  36.6 
 
 
158 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  37.5 
 
 
155 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  37.5 
 
 
155 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  37.5 
 
 
155 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  37.5 
 
 
155 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  37.5 
 
 
155 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  37.5 
 
 
155 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  37.84 
 
 
166 aa  94.4  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  37.84 
 
 
166 aa  94.4  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  40.76 
 
 
155 aa  94  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  37.5 
 
 
155 aa  93.6  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  41.06 
 
 
158 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
143 aa  92.8  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  36.02 
 
 
169 aa  91.7  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  38.36 
 
 
166 aa  90.1  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  38.93 
 
 
151 aa  90.1  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  37.58 
 
 
151 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2428  universal stress protein  40.65 
 
 
191 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1156  universal stress family protein  40.65 
 
 
201 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5869  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 
148 aa  90.1  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135871  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0705  universal stress protein  40.65 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.284573  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1230  universal stress family protein  40.65 
 
 
201 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296096  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0758  universal stress protein  40.65 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1723  universal stress protein  40.65 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  35.57 
 
 
154 aa  88.6  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  37.82 
 
 
161 aa  88.6  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  32.45 
 
 
157 aa  87.8  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1761  hypothetical protein  37.33 
 
 
150 aa  87.4  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 
145 aa  87.4  7e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4254  UspA domain-containing protein  39.33 
 
 
169 aa  87.4  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.462473  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  35.8 
 
 
187 aa  87  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  37.97 
 
 
154 aa  87  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  32.65 
 
 
150 aa  87  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4281  UspA domain-containing protein  39.35 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0794331 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  40.94 
 
 
144 aa  86.3  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4250  UspA domain-containing protein  36.94 
 
 
157 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216245  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  34.48 
 
 
147 aa  86.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1569  universal stress protein  38.16 
 
 
152 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3776  UspA domain-containing protein  36.31 
 
 
157 aa  85.5  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142255  normal  0.186417 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  35.1 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  30.06 
 
 
148 aa  85.1  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  38.46 
 
 
156 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3813  UspA domain-containing protein  38.82 
 
 
156 aa  85.1  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.175974  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 
156 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>