More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6198 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6198  UspA domain-containing protein  100 
 
 
156 aa  290  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.53809 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4281  UspA domain-containing protein  89.33 
 
 
156 aa  247  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0794331 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3813  UspA domain-containing protein  84.67 
 
 
156 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.175974  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5901  UspA domain-containing protein  83.23 
 
 
155 aa  223  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.475966  normal  0.0916735 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0705  universal stress protein  59.18 
 
 
152 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.284573  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0758  universal stress protein  59.18 
 
 
152 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1723  universal stress protein  59.18 
 
 
152 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2428  universal stress protein  59.18 
 
 
191 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1156  universal stress family protein  59.18 
 
 
201 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1230  universal stress family protein  59.59 
 
 
201 aa  157  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296096  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1569  universal stress protein  57.14 
 
 
152 aa  153  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  56.49 
 
 
156 aa  144  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  56.49 
 
 
156 aa  144  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5987  UspA domain-containing protein  56.49 
 
 
156 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1650  universal stress protein  54.25 
 
 
156 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262714  normal  0.111079 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5869  UspA domain-containing protein  54.42 
 
 
148 aa  134  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135871  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4254  UspA domain-containing protein  55.1 
 
 
169 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.462473  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  49.66 
 
 
158 aa  128  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3776  UspA domain-containing protein  53.74 
 
 
157 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142255  normal  0.186417 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4250  UspA domain-containing protein  53.06 
 
 
157 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216245  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1136  UspA domain-containing protein  51.01 
 
 
148 aa  118  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  45.33 
 
 
168 aa  104  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  42.38 
 
 
151 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  42 
 
 
187 aa  98.6  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  44 
 
 
168 aa  95.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  43.05 
 
 
151 aa  94.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  39.74 
 
 
151 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  39.74 
 
 
151 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  38.93 
 
 
187 aa  93.6  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  39.04 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  40.4 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  41.33 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  46 
 
 
164 aa  92  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  40.4 
 
 
156 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  39.19 
 
 
150 aa  91.7  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  39.46 
 
 
156 aa  91.3  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  39.22 
 
 
155 aa  90.5  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  39.07 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  38.27 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  39.74 
 
 
200 aa  89  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  40.65 
 
 
158 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  40.67 
 
 
155 aa  88.6  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  39.87 
 
 
155 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  41.72 
 
 
166 aa  87.4  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  41.72 
 
 
166 aa  87.4  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  39.07 
 
 
157 aa  87  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  36.67 
 
 
154 aa  87  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  39.07 
 
 
159 aa  87  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  38.93 
 
 
155 aa  87  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  39.07 
 
 
159 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  42.67 
 
 
167 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  40 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  41.4 
 
 
162 aa  86.3  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  40.67 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  40 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  40 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  40 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  40 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  38.51 
 
 
165 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3456  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 
164 aa  85.1  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198744  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  41.72 
 
 
166 aa  85.1  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  40.88 
 
 
173 aa  85.1  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  39.19 
 
 
155 aa  84.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  42.86 
 
 
151 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  42.86 
 
 
151 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  40 
 
 
151 aa  84.3  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  39.33 
 
 
155 aa  84  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  39.33 
 
 
156 aa  84  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  38.26 
 
 
158 aa  84  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  38.16 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  38.41 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1761  hypothetical protein  41.18 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  39.86 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  39.33 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  38.41 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  39.33 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  39.86 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  39.33 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  38.41 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  38.93 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  38 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  40.79 
 
 
157 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  41.72 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  40.13 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  42.38 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  34.21 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  38.26 
 
 
154 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  36.84 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  37.33 
 
 
157 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  34.64 
 
 
155 aa  77  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  39.87 
 
 
156 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  39.87 
 
 
156 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  39.87 
 
 
156 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  39.87 
 
 
200 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  39.87 
 
 
156 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  38.51 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  39.87 
 
 
156 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  35.53 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  34.46 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>