More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5818 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 153 aa  312  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  67.32 
 
 		 156 aa  224  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  66.89 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  59.6 
 
 		 200 aa  179  8.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  59.6 
 
 		 200 aa  168  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  59.6 
 
 		 156 aa  167  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  59.6 
 
 		 156 aa  167  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  59.6 
 
 		 156 aa  167  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  59.6 
 
 		 156 aa  167  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  59.6 
 
 		 156 aa  167  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  55.1 
 
 		 157 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  54.05 
 
 		 152 aa  157  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  53.69 
 
 		 159 aa  156  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  53.74 
 
 		 159 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  53.74 
 
 		 159 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  53.74 
 
 		 159 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  53.02 
 
 		 159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  55.1 
 
 		 162 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  52.38 
 
 		 151 aa  148  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  51.02 
 
 		 151 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  51.02 
 
 		 151 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  51.35 
 
 		 165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  50 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  49.66 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  50 
 
 		 184 aa  137  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  49.02 
 
 		 157 aa  137  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  45.52 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  47.26 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  45.03 
 
 		 156 aa  132  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  48.3 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  46.21 
 
 		 168 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  47.26 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  47.26 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  47.26 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  47.26 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  47.26 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  47.26 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  47.95 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  47.95 
 
 		 163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  44.83 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  47.26 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  46.62 
 
 		 150 aa  117  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  42.07 
 
 		 187 aa  117  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  41.38 
 
 		 167 aa  114  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  41.5 
 
 		 155 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  44.97 
 
 		 167 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  42.95 
 
 		 151 aa  110  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  43.15 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  42.07 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  42.07 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  42.07 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  40.4 
 
 		 166 aa  107  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  41.45 
 
 		 166 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  41.45 
 
 		 166 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  41.06 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  41.38 
 
 		 155 aa  104  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  42.57 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 155 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4250  UspA domain-containing protein  40.79 
 
 		 157 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3776  UspA domain-containing protein  40.13 
 
 		 157 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142255  normal  0.186417 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  38.56 
 
 		 156 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1650  universal stress protein  40.88 
 
 		 156 aa  101  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262714  normal  0.111079 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 158 aa  100  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  37.75 
 
 		 157 aa  99.8  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5869  UspA domain-containing protein  40.82 
 
 		 148 aa  99.4  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  36.67 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  36.42 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  42 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  36.42 
 
 		 145 aa  98.6  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5987  UspA domain-containing protein  39.47 
 
 		 156 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  39.47 
 
 		 156 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  42 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  39.47 
 
 		 156 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4281  UspA domain-containing protein  39.19 
 
 		 156 aa  98.2  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0794331 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1890  putative universal stress protein, UspA-like  42.38 
 
 		 317 aa  97.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  39.61 
 
 		 155 aa  97.1  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  39.61 
 
 		 155 aa  97.1  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  39.61 
 
 		 155 aa  97.1  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  39.61 
 
 		 155 aa  97.1  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  39.61 
 
 		 155 aa  97.1  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6247  UspA domain-containing protein  40.41 
 
 		 313 aa  97.4  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.887249 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  43.15 
 
 		 155 aa  97.1  8e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  39.61 
 
 		 155 aa  96.7  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  37.25 
 
 		 155 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  36.84 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  38.16 
 
 		 155 aa  96.3  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  39.47 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4254  UspA domain-containing protein  38.41 
 
 		 169 aa  95.5  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.462473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1268  universal stress protein  39.04 
 
 		 315 aa  95.1  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5820  UspA domain-containing protein  42.38 
 
 		 318 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131616 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  38.16 
 
 		 151 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  38.16 
 
 		 151 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 145 aa  94  6e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  38.78 
 
 		 151 aa  93.6  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0758  universal stress protein  39.07 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0705  universal stress protein  39.07 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.284573  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1723  universal stress protein  39.07 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  32.89 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  35.06 
 
 		 150 aa  92  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2428  universal stress protein  39.07 
 
 		 191 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>