More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3147 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  100 
 
 
150 aa  295  1e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  65.33 
 
 
150 aa  197  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  52.7 
 
 
150 aa  165  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  50 
 
 
151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  48.32 
 
 
149 aa  143  9e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  46.62 
 
 
164 aa  140  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  46.15 
 
 
157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  49.65 
 
 
141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  48.97 
 
 
148 aa  130  6e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  44 
 
 
156 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  44.68 
 
 
180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  48.95 
 
 
143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  42.18 
 
 
145 aa  120  7e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  43.26 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  40.82 
 
 
145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  42.55 
 
 
147 aa  117  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  42.14 
 
 
165 aa  116  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  47.97 
 
 
120 aa  115  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  40.82 
 
 
145 aa  115  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  38.62 
 
 
143 aa  114  6e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 
145 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  41.67 
 
 
148 aa  111  3e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  40 
 
 
147 aa  111  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  40.43 
 
 
208 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  39.33 
 
 
290 aa  107  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  39.31 
 
 
158 aa  107  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  39.01 
 
 
152 aa  107  8.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  39.31 
 
 
152 aa  106  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  37.93 
 
 
207 aa  105  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  43.97 
 
 
138 aa  104  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  39.33 
 
 
156 aa  104  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  43.85 
 
 
130 aa  103  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  36.36 
 
 
155 aa  103  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  39.58 
 
 
148 aa  103  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  41.26 
 
 
144 aa  102  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  37.59 
 
 
159 aa  101  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 
144 aa  100  8e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  35.17 
 
 
307 aa  97.4  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  38.73 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  35.71 
 
 
145 aa  96.7  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  35.33 
 
 
156 aa  96.7  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  36 
 
 
153 aa  95.1  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2183  hypothetical protein  32.75 
 
 
176 aa  95.1  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  36.24 
 
 
200 aa  94  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 
153 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  39.19 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 
141 aa  90.9  6e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  34.04 
 
 
144 aa  90.5  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 
153 aa  90.1  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 
449 aa  90.1  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3055  UspA domain protein  33.33 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  33.33 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  37.14 
 
 
141 aa  89.4  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  89  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 
156 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 
156 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  33.8 
 
 
139 aa  87.8  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  37.16 
 
 
151 aa  87.8  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  34.75 
 
 
286 aa  87.4  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  32.19 
 
 
149 aa  87.8  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  34.27 
 
 
162 aa  87  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  34.13 
 
 
169 aa  87  8e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  38.03 
 
 
301 aa  87  9e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  33.33 
 
 
152 aa  86.7  9e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  37.67 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
138 aa  86.3  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  37.06 
 
 
287 aa  86.3  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 
142 aa  85.9  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  36.84 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  33.56 
 
 
157 aa  85.1  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  37.32 
 
 
139 aa  85.1  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  34.64 
 
 
150 aa  84.7  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 
157 aa  84.7  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 
145 aa  84.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 
157 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  33.11 
 
 
152 aa  84  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  35.62 
 
 
288 aa  84  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 
147 aa  84  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  33.79 
 
 
149 aa  83.6  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 
159 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  32.72 
 
 
200 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  32.89 
 
 
159 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 
159 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  32.72 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  32.72 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  34.75 
 
 
297 aa  83.2  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  32.72 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  32.72 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  32.72 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  35.21 
 
 
136 aa  82.4  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  34.23 
 
 
142 aa  82  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  33.55 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  31.21 
 
 
153 aa  82  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  30.07 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  31.58 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>