More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0308 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 145 aa  285  1e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  97.24 
 
 		 145 aa  278  2e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  97.24 
 
 		 145 aa  276  5e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  82.07 
 
 		 145 aa  245  2e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  66.21 
 
 		 148 aa  204  3e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  47.52 
 
 		 150 aa  141  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  45 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  42.14 
 
 		 180 aa  127  4.0000000000000003e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  43.54 
 
 		 157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  44.85 
 
 		 141 aa  121  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  45 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  46.48 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  39.29 
 
 		 164 aa  120  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  40.71 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  40.82 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  40 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  43.66 
 
 		 148 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  42.25 
 
 		 151 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  41.38 
 
 		 147 aa  110  9e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  42.75 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  42.14 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  42.36 
 
 		 148 aa  103  8e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  44.67 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  37.14 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  39.86 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  33.57 
 
 		 307 aa  101  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  38.24 
 
 		 165 aa  101  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  37.06 
 
 		 156 aa  100  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  37.58 
 
 		 144 aa  100  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  36.67 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  36.05 
 
 		 155 aa  98.2  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  36.88 
 
 		 142 aa  98.2  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  39.42 
 
 		 143 aa  97.4  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  39.86 
 
 		 140 aa  97.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  37.59 
 
 		 144 aa  97.4  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  36.24 
 
 		 156 aa  97.1  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  37.84 
 
 		 152 aa  97.1  8e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  37.84 
 
 		 153 aa  95.9  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  36.11 
 
 		 290 aa  95.5  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  39.06 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 		 145 aa  94.4  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  35.57 
 
 		 156 aa  94.4  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  38.3 
 
 		 145 aa  94  7e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 		 148 aa  93.6  8e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  36.88 
 
 		 142 aa  92.8  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  36.84 
 
 		 200 aa  93.2  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  37.16 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  35.66 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  36.24 
 
 		 305 aa  92  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  34 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  34 
 
 		 156 aa  92  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  37.5 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  38.16 
 
 		 200 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  38.16 
 
 		 156 aa  90.5  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  38.16 
 
 		 156 aa  90.5  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  38.16 
 
 		 156 aa  90.5  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  38.16 
 
 		 156 aa  90.5  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  38.16 
 
 		 156 aa  90.5  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  37.67 
 
 		 145 aa  90.9  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  39.13 
 
 		 141 aa  90.5  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  32.87 
 
 		 208 aa  89.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  36.36 
 
 		 156 aa  90.1  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  36.43 
 
 		 300 aa  89.4  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  35.71 
 
 		 153 aa  88.6  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  37.06 
 
 		 153 aa  88.2  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  39.44 
 
 		 145 aa  87.8  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  32.87 
 
 		 207 aa  88.2  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  36.17 
 
 		 150 aa  87.4  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  36.43 
 
 		 142 aa  87.8  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  35.17 
 
 		 149 aa  87.4  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  34.03 
 
 		 150 aa  87  8e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 		 145 aa  86.7  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.577691 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  32.86 
 
 		 287 aa  85.5  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  38.33 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  34.29 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  36.18 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  33.57 
 
 		 297 aa  85.5  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  37.5 
 
 		 147 aa  84.7  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  35.66 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  35.14 
 
 		 184 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  33.57 
 
 		 283 aa  85.1  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  35.21 
 
 		 280 aa  84.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  34.69 
 
 		 168 aa  84.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  32.89 
 
 		 165 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  35.92 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  36.62 
 
 		 415 aa  84  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  39.07 
 
 		 163 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 		 142 aa  84  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 		 153 aa  84  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 157 aa  84  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  32.86 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  35.66 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3055  UspA domain protein  37.06 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  35.33 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 324 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  37.09 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>