More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1890 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1890  putative universal stress protein, UspA-like  100 
 
 		 317 aa  628  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5604  UspA domain protein  75.95 
 
 		 317 aa  477  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.945797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5820  UspA domain-containing protein  56.19 
 
 		 318 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131616 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1102  UspA domain-containing protein  49.84 
 
 		 319 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1525  universal stress family protein  48.99 
 
 		 315 aa  275  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6247  UspA domain-containing protein  49.32 
 
 		 313 aa  275  9e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.887249 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  48.65 
 
 		 319 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1268  universal stress protein  48.65 
 
 		 315 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1610  universal stress family protein  48.65 
 
 		 315 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6234  UspA domain-containing protein  46.45 
 
 		 316 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5983  UspA domain-containing protein  48 
 
 		 311 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965919 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1645  universal stress protein  48.67 
 
 		 311 aa  268  8e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206293  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4249  UspA domain-containing protein  47.84 
 
 		 312 aa  267  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3995  hypothetical protein  46.67 
 
 		 311 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4372  UspA domain-containing protein  46.67 
 
 		 311 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.520277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3786  UspA domain-containing protein  46.15 
 
 		 311 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5324  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4253  UspA domain-containing protein  46.82 
 
 		 314 aa  255  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5859  UspA domain-containing protein  46.03 
 
 		 317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.689351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  42.38 
 
 		 153 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  43.66 
 
 		 165 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  40.14 
 
 		 168 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  41.55 
 
 		 157 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  38.89 
 
 		 151 aa  89.7  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  38.89 
 
 		 151 aa  89.7  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  40 
 
 		 151 aa  89  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  38.51 
 
 		 156 aa  87.4  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  40.28 
 
 		 156 aa  87  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  43.36 
 
 		 167 aa  87  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  39.04 
 
 		 187 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  38.73 
 
 		 168 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  35.76 
 
 		 156 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  43.57 
 
 		 163 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  37.58 
 
 		 184 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  43.26 
 
 		 163 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  36.55 
 
 		 157 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  41.43 
 
 		 164 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 		 159 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  36.81 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  29.08 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  41.26 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  36.67 
 
 		 200 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  35.21 
 
 		 152 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  42.14 
 
 		 167 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  32.11 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  29.88 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  39.01 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  25.81 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  37.93 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  37.93 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  37.93 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  37.93 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  37.93 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  37.93 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  39.01 
 
 		 155 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  30.83 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  40.43 
 
 		 167 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  34.23 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  28.84 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  36.18 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  33.04 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  28.89 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  40 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  40 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  40 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  40 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  40 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  40 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  28.89 
 
 		 297 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 		 155 aa  72  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 		 155 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  33.01 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  35.92 
 
 		 155 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  35.92 
 
 		 155 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  30.08 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 		 155 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  32.88 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  33.11 
 
 		 151 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  38.78 
 
 		 155 aa  70.9  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  29.05 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  25.67 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  31.29 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  34.23 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  33.55 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  28.95 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  28.57 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  38.26 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  27.44 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  36.91 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  36.91 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  30.13 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 157 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  35.71 
 
 		 155 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  28.62 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 158 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>