More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5820 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5820  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 318 aa  630  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131616 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1102  UspA domain-containing protein  60 
 
 		 319 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1890  putative universal stress protein, UspA-like  56.19 
 
 		 317 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5604  UspA domain protein  53.02 
 
 		 317 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.945797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6234  UspA domain-containing protein  50.33 
 
 		 316 aa  288  8e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6247  UspA domain-containing protein  48.39 
 
 		 313 aa  276  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.887249 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5859  UspA domain-containing protein  47.51 
 
 		 317 aa  258  9e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.689351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1268  universal stress protein  46.84 
 
 		 315 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  47.18 
 
 		 319 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1525  universal stress family protein  47.18 
 
 		 315 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1610  universal stress family protein  47.18 
 
 		 315 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5983  UspA domain-containing protein  45.36 
 
 		 311 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965919 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3995  hypothetical protein  45.03 
 
 		 311 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4372  UspA domain-containing protein  45.03 
 
 		 311 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.520277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4249  UspA domain-containing protein  45.03 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3786  UspA domain-containing protein  44.37 
 
 		 311 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5324  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4253  UspA domain-containing protein  44.97 
 
 		 314 aa  235  8e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1645  universal stress protein  44.63 
 
 		 311 aa  228  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206293  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  43.84 
 
 		 151 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  43.84 
 
 		 151 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  44.52 
 
 		 151 aa  105  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  41.67 
 
 		 168 aa  99.8  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  42.38 
 
 		 153 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  44.76 
 
 		 187 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  44.68 
 
 		 164 aa  94.4  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 156 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  42.76 
 
 		 159 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  40.94 
 
 		 184 aa  92.8  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  43.84 
 
 		 167 aa  92.8  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  42.76 
 
 		 159 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  42.95 
 
 		 200 aa  91.3  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  40.94 
 
 		 156 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  39.86 
 
 		 156 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  39.58 
 
 		 168 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  41.38 
 
 		 159 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  41.38 
 
 		 159 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  30.41 
 
 		 320 aa  90.1  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  41.38 
 
 		 159 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  46.48 
 
 		 163 aa  89.4  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  36.53 
 
 		 304 aa  89.4  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  40.69 
 
 		 157 aa  89  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  41.13 
 
 		 157 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  45.07 
 
 		 167 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  43.26 
 
 		 164 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  43.26 
 
 		 164 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  43.26 
 
 		 164 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  43.26 
 
 		 164 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  43.26 
 
 		 164 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  43.26 
 
 		 164 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  44.44 
 
 		 163 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  28.62 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  42.28 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  42.76 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  42.76 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  42.76 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  42.76 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  42.76 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  37.76 
 
 		 152 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  42.66 
 
 		 162 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  29.32 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  39.44 
 
 		 155 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  36.81 
 
 		 151 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  38.89 
 
 		 165 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  29.26 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  39.44 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  38.93 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  40.97 
 
 		 167 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  31.92 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  29.28 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  37.75 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  36.3 
 
 		 158 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  31.96 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  34.4 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  35.42 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  31.55 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  25.16 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  36.36 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  25.57 
 
 		 287 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  37.41 
 
 		 155 aa  72.4  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4815  UspA domain protein  32.91 
 
 		 155 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  39.44 
 
 		 157 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  30.36 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  35.57 
 
 		 169 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  35.66 
 
 		 155 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3738  UspA domain protein  32.91 
 
 		 155 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 		 158 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  30 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  35.42 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  35.42 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1136  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  35.42 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  35.42 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  35.42 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  25 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>