More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3738 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4815  UspA domain protein  100 
 
 		 155 aa  308  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3738  UspA domain protein  100 
 
 		 155 aa  308  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05449  hypothetical protein  79.35 
 
 		 155 aa  240  5e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504029  normal  0.0915298 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  37.16 
 
 		 151 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  37.16 
 
 		 151 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  34.46 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  34.44 
 
 		 157 aa  97.4  6e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  34.39 
 
 		 153 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  35.26 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  34.9 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4281  UspA domain-containing protein  36.67 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0794331 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  34.9 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  32.24 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3813  UspA domain-containing protein  38 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.175974  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  32.69 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  28.29 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  33.76 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5820  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 		 318 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131616 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  31.01 
 
 		 168 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  36.36 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  31.03 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6198  UspA domain-containing protein  36.48 
 
 		 156 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.53809 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  33.11 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1230  universal stress family protein  35.76 
 
 		 201 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296096  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  33.55 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2428  universal stress protein  35.85 
 
 		 191 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1156  universal stress family protein  35.85 
 
 		 201 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  30.14 
 
 		 200 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1569  universal stress protein  33.96 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1761  hypothetical protein  33.97 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  30.57 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  30.57 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5901  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.475966  normal  0.0916735 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  32.24 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  30.61 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  31.72 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1723  universal stress protein  35.85 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0705  universal stress protein  35.85 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.284573  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  32.26 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1268  universal stress protein  33.88 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  30.86 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0758  universal stress protein  35.85 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1610  universal stress family protein  30.82 
 
 		 315 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  34.19 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1525  universal stress family protein  30.82 
 
 		 315 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  29.93 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  30.82 
 
 		 319 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  32.9 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  32.9 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  31.82 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5987  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  29.3 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5604  UspA domain protein  38.21 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.945797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  30 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  32.67 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  30.82 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1102  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  32.21 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5869  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  32.9 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  31.85 
 
 		 305 aa  64.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  32.43 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  34.21 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  32.67 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1650  universal stress protein  34.38 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262714  normal  0.111079 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5983  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 311 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965919 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1890  putative universal stress protein, UspA-like  32.67 
 
 		 317 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3995  hypothetical protein  32.64 
 
 		 311 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4372  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 311 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.520277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  30.34 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3786  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 		 311 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5324  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4253  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 		 314 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  29.87 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1645  universal stress protein  32.64 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206293  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  30.61 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  29.87 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  30.92 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  29.87 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  30.92 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  30.92 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  30.92 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  30.92 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  30.92 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3456  UspA domain-containing protein  29.49 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  29.45 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  29.22 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  25.83 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  36.6 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  28 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>