More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1851 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  100 
 
 
142 aa  277  3e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  41.67 
 
 
144 aa  96.7  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  39.44 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 
145 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  39.44 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  40.14 
 
 
149 aa  95.9  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  39.16 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  39.01 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  39.31 
 
 
154 aa  94.4  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  37.58 
 
 
144 aa  93.6  8e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  41.5 
 
 
142 aa  93.6  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
144 aa  92.8  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  38.51 
 
 
164 aa  92.8  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  36.99 
 
 
169 aa  92.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  38.13 
 
 
165 aa  91.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  37.76 
 
 
142 aa  90.1  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  39.44 
 
 
140 aa  90.1  9e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  40.56 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 
142 aa  88.6  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  37.24 
 
 
151 aa  89  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  38.89 
 
 
142 aa  88.2  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  37.76 
 
 
143 aa  87.8  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  36.05 
 
 
151 aa  87.8  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  38.03 
 
 
147 aa  87.4  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  34.93 
 
 
173 aa  86.3  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  32.65 
 
 
157 aa  85.5  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  33.57 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  36.55 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 
138 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  34.48 
 
 
148 aa  85.5  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  35.71 
 
 
142 aa  84.7  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  33.57 
 
 
150 aa  85.1  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  35.21 
 
 
145 aa  84.7  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  40 
 
 
138 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  38.67 
 
 
148 aa  84  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  35.25 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  35.37 
 
 
151 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 
128 aa  83.2  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  38.67 
 
 
128 aa  83.2  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  36.73 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  33.56 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  34.69 
 
 
147 aa  82  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  37.23 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  33.09 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  35.37 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  41.43 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1760  hypothetical protein  37.16 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  36.73 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  34.72 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  35.37 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  35.17 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 
155 aa  80.9  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  33.8 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  37.59 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  35.37 
 
 
164 aa  80.9  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  32.65 
 
 
155 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  37.32 
 
 
148 aa  80.1  0.000000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  35 
 
 
283 aa  80.1  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1761  hypothetical protein  37.33 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  33.79 
 
 
141 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  38.62 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  32.88 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  29.58 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  36 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  34.46 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  32.9 
 
 
325 aa  79.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  34.01 
 
 
166 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  38.41 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  33.8 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  37.32 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4708  hypothetical protein  36.73 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  33.33 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  36.05 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  32.03 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  36.96 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  31.47 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  34.46 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  32.87 
 
 
180 aa  77.4  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  31.29 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  32.68 
 
 
300 aa  77.4  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  33.11 
 
 
161 aa  77  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2102  UspA domain protein  35.21 
 
 
289 aa  77  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3418  UspA domain protein  35.66 
 
 
133 aa  77  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  33.1 
 
 
154 aa  76.6  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  30.61 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  31.69 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  31.47 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0816  UspA family nucleotide-binding protein  32.88 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000142801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>