More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5983 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5983  UspA domain-containing protein  100 
 
 
311 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.965919 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3995  hypothetical protein  97.11 
 
 
311 aa  597  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4372  UspA domain-containing protein  97.11 
 
 
311 aa  597  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.520277  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1645  universal stress protein  91 
 
 
311 aa  566  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206293  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3786  UspA domain-containing protein  86.08 
 
 
311 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5324  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4249  UspA domain-containing protein  83.17 
 
 
312 aa  521  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4253  UspA domain-containing protein  87.33 
 
 
314 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162019  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1890  putative universal stress protein, UspA-like  48 
 
 
317 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508321  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5604  UspA domain protein  46.15 
 
 
317 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.945797  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6247  UspA domain-containing protein  43.73 
 
 
313 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.887249 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5820  UspA domain-containing protein  45.36 
 
 
318 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.131616 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6234  UspA domain-containing protein  40.85 
 
 
316 aa  235  7e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894885  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1268  universal stress protein  41.95 
 
 
315 aa  226  4e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  42.28 
 
 
319 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1525  universal stress family protein  42.28 
 
 
315 aa  221  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1610  universal stress family protein  42.28 
 
 
315 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1102  UspA domain-containing protein  39.94 
 
 
319 aa  220  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5859  UspA domain-containing protein  40.86 
 
 
317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.689351  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  40.82 
 
 
151 aa  87  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  37.84 
 
 
151 aa  86.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  37.84 
 
 
151 aa  86.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  38.93 
 
 
153 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  37.33 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  40.56 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  31.29 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  23.98 
 
 
295 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 
156 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  39.46 
 
 
187 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  34.27 
 
 
168 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  36.36 
 
 
168 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 
159 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  29.93 
 
 
150 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  40.82 
 
 
157 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 
159 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  32.19 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  35.86 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  25.48 
 
 
300 aa  72.4  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  35.17 
 
 
157 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  34.81 
 
 
200 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 
147 aa  71.6  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  32.88 
 
 
147 aa  70.5  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  36.73 
 
 
164 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  35.14 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  34.72 
 
 
152 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 
158 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  36.73 
 
 
156 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  36.73 
 
 
156 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  36.73 
 
 
156 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  36.73 
 
 
156 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  38.19 
 
 
184 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  36.73 
 
 
156 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  32.67 
 
 
156 aa  67  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  27.24 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  35.48 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  35.86 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  34.27 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  29.87 
 
 
145 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 
155 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 
144 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  33.1 
 
 
155 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 
144 aa  63.5  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
155 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4815  UspA domain protein  35.71 
 
 
155 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  33.57 
 
 
155 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3738  UspA domain protein  35.71 
 
 
155 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
155 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 
150 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
155 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  35.42 
 
 
155 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
156 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 
143 aa  63.2  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  33.1 
 
 
155 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 
163 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  32.68 
 
 
151 aa  62.8  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  29.22 
 
 
145 aa  62.4  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  33.57 
 
 
291 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  28.48 
 
 
148 aa  62  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  28.77 
 
 
164 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  29.22 
 
 
145 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  41.58 
 
 
164 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 
300 aa  61.6  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  33.1 
 
 
153 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  41.58 
 
 
164 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  41.58 
 
 
164 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  41.58 
 
 
164 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  30.16 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
157 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  41.58 
 
 
164 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  29.22 
 
 
145 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  41.58 
 
 
164 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 
167 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  35.33 
 
 
158 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  32.89 
 
 
156 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  28.1 
 
 
304 aa  60.5  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05449  hypothetical protein  32 
 
 
155 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504029  normal  0.0915298 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  26.53 
 
 
307 aa  60.1  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>