More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3238 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  100 
 
 		 297 aa  587  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  49.09 
 
 		 282 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  43.57 
 
 		 280 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  45.65 
 
 		 280 aa  189  4e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2471  UspA domain protein  32.51 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.584159  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  32.04 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2102  UspA domain protein  32.63 
 
 		 289 aa  102  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  29.68 
 
 		 289 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  30.36 
 
 		 300 aa  99  8e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  35.54 
 
 		 281 aa  98.2  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  29.72 
 
 		 288 aa  96.3  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  28.27 
 
 		 288 aa  95.1  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  26.82 
 
 		 449 aa  94  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 291 aa  92.8  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  26.64 
 
 		 278 aa  90.5  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  28.24 
 
 		 317 aa  89  8e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  29.63 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  26.35 
 
 		 297 aa  85.9  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  43.8 
 
 		 158 aa  85.9  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  30.58 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  28.23 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  39.42 
 
 		 149 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  31.41 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  35.39 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  31.53 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2416  universal stress protein UspE  25.67 
 
 		 310 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.268854  decreased coverage  0.000000187412 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  26.9 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  31.86 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  37.14 
 
 		 138 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  32.21 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  27.43 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  40.16 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  42.34 
 
 		 159 aa  78.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  38.03 
 
 		 156 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  28.98 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3712  universal stress protein  28.18 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2560  UspA domain protein  28.12 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  35.18 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  29.58 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  34.06 
 
 		 139 aa  75.1  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1994  universal stress protein UspE  27.8 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  29.02 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 145 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  36.23 
 
 		 147 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  28.01 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  27.99 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  29.68 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  39.29 
 
 		 148 aa  74.3  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  25.62 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2223  universal stress protein UspE  25.25 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  29.3 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 145 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  22.86 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  50 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  34.27 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  31.92 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  25.77 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  46.15 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  32.58 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  33.57 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1890  putative universal stress protein, UspA-like  28.89 
 
 		 317 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  30.82 
 
 		 157 aa  72  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  39.42 
 
 		 143 aa  72  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 		 145 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  34.78 
 
 		 154 aa  72.4  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4818  UspA domain protein  27.8 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0832286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  39.57 
 
 		 158 aa  71.6  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  39.26 
 
 		 156 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 		 145 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  34.56 
 
 		 145 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  36.03 
 
 		 145 aa  70.9  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  35.97 
 
 		 154 aa  70.5  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  35.46 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  31.21 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  37.68 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  39.01 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1541  hypothetical protein  39.72 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  30.43 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  32.87 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  32.58 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  32.88 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  32.93 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0415  UspA domain protein  31.68 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.189257 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  34.75 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2161  universal stress protein UspE  24.76 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0882327  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5820  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131616 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  37.32 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  28.87 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  28.07 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  28.04 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  33.33 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  26.35 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  38.3 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2210  universal stress protein UspE  24.76 
 
 		 310 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000689351  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4496  universal stress protein UspE  24.76 
 
 		 310 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>