More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1009 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  100 
 
 		 304 aa  595  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  39.61 
 
 		 320 aa  179  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  40 
 
 		 283 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  37.9 
 
 		 305 aa  142  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  34.33 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  37.75 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  34.33 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  34.67 
 
 		 415 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  33.55 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  26.89 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  33.67 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  38.05 
 
 		 280 aa  119  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  34 
 
 		 297 aa  119  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  30.79 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  33.89 
 
 		 297 aa  115  8.999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  26.17 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  32.46 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  33.67 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  32.57 
 
 		 287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  27.42 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  33.33 
 
 		 283 aa  108  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  32.14 
 
 		 314 aa  106  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  31.68 
 
 		 303 aa  105  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  32.71 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  30.79 
 
 		 286 aa  102  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44930  Usp-like protein  30.9 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  33.12 
 
 		 306 aa  99.4  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  32.56 
 
 		 291 aa  99.4  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  27.8 
 
 		 287 aa  99  9e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  33.99 
 
 		 325 aa  98.6  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  32.89 
 
 		 305 aa  97.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  32.79 
 
 		 311 aa  97.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  29.15 
 
 		 289 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  29.81 
 
 		 449 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  32.01 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  29.95 
 
 		 287 aa  94  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  29.74 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  31.37 
 
 		 317 aa  94  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_002936  DET0674  universal stress protein  29.95 
 
 		 296 aa  93.2  5e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  29.29 
 
 		 288 aa  92.4  8e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1268  universal stress protein  31.07 
 
 		 315 aa  92.4  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  30 
 
 		 282 aa  92.4  9e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  27.6 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  40.41 
 
 		 170 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  40.41 
 
 		 170 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  33.2 
 
 		 323 aa  90.5  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  38.1 
 
 		 145 aa  90.1  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  31.33 
 
 		 298 aa  89.7  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  36 
 
 		 149 aa  89.7  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  33.88 
 
 		 291 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  30.23 
 
 		 296 aa  89.7  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  34.75 
 
 		 153 aa  89.7  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  29.49 
 
 		 298 aa  89.7  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5820  UspA domain-containing protein  36.53 
 
 		 318 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131616 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  35.48 
 
 		 149 aa  89.4  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  41.1 
 
 		 169 aa  89  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  27.92 
 
 		 282 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  39.16 
 
 		 147 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  34.06 
 
 		 154 aa  88.6  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 		 145 aa  88.6  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1610  universal stress family protein  29.9 
 
 		 315 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  38.1 
 
 		 145 aa  87.8  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  35.05 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  38.1 
 
 		 147 aa  87.8  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  40.27 
 
 		 152 aa  87.4  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1525  universal stress family protein  35.05 
 
 		 315 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6247  UspA domain-containing protein  29.77 
 
 		 313 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.887249 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  29.71 
 
 		 294 aa  87.4  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  27.78 
 
 		 282 aa  87.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  34.11 
 
 		 325 aa  86.7  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 		 324 aa  85.5  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  39.13 
 
 		 156 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  30.58 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  24.16 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  40.13 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  32.24 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  31.45 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  36.99 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1270  universal stress protein  35.92 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  33.33 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  37.24 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  38.12 
 
 		 156 aa  82  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  32.54 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  30.65 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1584  UspA domain protein  26.64 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  39.44 
 
 		 162 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  42.21 
 
 		 159 aa  80.9  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  39.33 
 
 		 173 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5859  UspA domain-containing protein  30.25 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.689351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  42.25 
 
 		 158 aa  81.3  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  37.31 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2256  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  32.45 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  40.54 
 
 		 154 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  39.44 
 
 		 162 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  34.52 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  37.16 
 
 		 144 aa  80.9  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0641  UspA domain-containing protein  29.71 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>