More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0487 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  100 
 
 
150 aa  301  1.0000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  63.51 
 
 
150 aa  201  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  65.33 
 
 
150 aa  197  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  55.03 
 
 
151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  54 
 
 
149 aa  157  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  48.97 
 
 
164 aa  155  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  54.61 
 
 
141 aa  153  7e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  51.35 
 
 
148 aa  148  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  49.3 
 
 
145 aa  149  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  46.9 
 
 
180 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  47.52 
 
 
145 aa  144  6e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  49.64 
 
 
165 aa  142  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  47.52 
 
 
145 aa  141  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  47.65 
 
 
157 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  48 
 
 
156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  46.81 
 
 
145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  46.43 
 
 
148 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  48.23 
 
 
152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  45.07 
 
 
148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  40.43 
 
 
158 aa  123  7e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  45.77 
 
 
147 aa  123  9e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  43.26 
 
 
142 aa  122  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  42.14 
 
 
159 aa  122  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  42.07 
 
 
143 aa  121  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  42.28 
 
 
147 aa  120  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  47.5 
 
 
120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  43.85 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 
142 aa  110  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  41.67 
 
 
152 aa  110  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  39.31 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  40.51 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  41.67 
 
 
148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  39.72 
 
 
208 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  37.42 
 
 
155 aa  108  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2183  hypothetical protein  37.5 
 
 
176 aa  107  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  37.59 
 
 
307 aa  107  7.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  41.96 
 
 
143 aa  105  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  38.57 
 
 
290 aa  105  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  40.85 
 
 
142 aa  104  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  38.1 
 
 
153 aa  102  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  39.01 
 
 
144 aa  102  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  39.01 
 
 
142 aa  102  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  41.61 
 
 
144 aa  101  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  39.01 
 
 
152 aa  101  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  43.88 
 
 
141 aa  100  7e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  38.03 
 
 
147 aa  100  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  38.62 
 
 
145 aa  99.8  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  35.71 
 
 
156 aa  99.8  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  36.88 
 
 
156 aa  99  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  37.67 
 
 
297 aa  98.6  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  34.72 
 
 
143 aa  96.7  9e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  37.32 
 
 
142 aa  95.5  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  36 
 
 
207 aa  95.9  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  35.97 
 
 
139 aa  94.4  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  36.17 
 
 
153 aa  94.7  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  43.54 
 
 
144 aa  94.4  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  39.72 
 
 
138 aa  94  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  36.3 
 
 
288 aa  93.6  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  34.01 
 
 
149 aa  93.2  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  35.17 
 
 
149 aa  91.7  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 
156 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  37.01 
 
 
153 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  37.16 
 
 
147 aa  90.9  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 
156 aa  90.1  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  36.62 
 
 
136 aa  90.1  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3055  UspA domain protein  36.3 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  35.71 
 
 
169 aa  89.4  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  33.56 
 
 
150 aa  89  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  34.27 
 
 
283 aa  88.6  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  40.4 
 
 
151 aa  88.6  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  34.97 
 
 
283 aa  88.6  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  35.81 
 
 
300 aa  88.6  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  40.4 
 
 
151 aa  88.2  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  33.56 
 
 
305 aa  87.8  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  37.16 
 
 
150 aa  87.8  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  34.93 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  35.42 
 
 
147 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  35.42 
 
 
147 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  37.84 
 
 
151 aa  87.4  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
128 aa  87  8e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  34.46 
 
 
200 aa  87  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  34.44 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  34.44 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  34.44 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  34.44 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  34.44 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  32.47 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  34.44 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  34.72 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  34.44 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  34.44 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  30.32 
 
 
156 aa  85.1  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  32.88 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  39.86 
 
 
138 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  35.53 
 
 
173 aa  84.7  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  35.33 
 
 
154 aa  84.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  36.42 
 
 
148 aa  84.7  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 
153 aa  84.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>