More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0480 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  100 
 
 
144 aa  279  7.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  47.1 
 
 
145 aa  122  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  45.7 
 
 
156 aa  97.4  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  42.76 
 
 
180 aa  97.1  8e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  41.73 
 
 
145 aa  95.9  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  46.04 
 
 
290 aa  92  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  40.82 
 
 
156 aa  91.3  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  42.36 
 
 
307 aa  88.6  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  38.57 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  39.86 
 
 
152 aa  88.2  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  43.88 
 
 
208 aa  88.6  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  34.93 
 
 
150 aa  88.2  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  40.29 
 
 
288 aa  87.4  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  37.86 
 
 
147 aa  86.3  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  38.36 
 
 
149 aa  85.9  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  38.1 
 
 
153 aa  84.7  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  37.41 
 
 
155 aa  84.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  38.62 
 
 
297 aa  84.7  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  38.85 
 
 
207 aa  84.3  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  40.71 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  40.29 
 
 
286 aa  83.2  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  32.87 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  37.5 
 
 
300 aa  82.4  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  36.9 
 
 
169 aa  82  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  32.12 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  32.17 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  40.29 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  41.73 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  40 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  40.58 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  39.57 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  40 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  39.58 
 
 
149 aa  79  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 
148 aa  79  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  30.82 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  30.99 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  35.92 
 
 
136 aa  77.4  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  38.36 
 
 
156 aa  77  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  40.56 
 
 
280 aa  77  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3170  UspA domain protein  38.78 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  38.19 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  37.93 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  32.37 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  38.85 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2084  UspA domain protein  35.86 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.65 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  33.09 
 
 
165 aa  73.6  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  31.69 
 
 
151 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  32.64 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  34.9 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  30.82 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  33.33 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  36.43 
 
 
301 aa  72.4  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  31.76 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  31.85 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  35.25 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  38.46 
 
 
283 aa  70.9  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  30.5 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  37.59 
 
 
281 aa  70.9  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  38.51 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  30.94 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1862  UspA domain protein  40.71 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0496809 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  36.11 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  33.58 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4249  UspA domain protein  39.72 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  26.03 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  36.81 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  35 
 
 
305 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  40.29 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  37.86 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  38.69 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 
297 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  30.15 
 
 
150 aa  67  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  31.11 
 
 
141 aa  67  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  31.11 
 
 
154 aa  67  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  32.41 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1531  UspA domain protein  29.37 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00154671  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  28.76 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  39.29 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  31.79 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  35.17 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  35.25 
 
 
128 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  36.36 
 
 
415 aa  65.1  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  32.87 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01240  universal stress protein UspA-like protein  34.46 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  34.75 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  35.29 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  34.29 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3055  UspA domain protein  34.27 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1529  hypothetical protein  31.39 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>