More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1196 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 142 aa  285  1e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  60.28 
 
 		 142 aa  180  5.0000000000000004e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  56.34 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  49.3 
 
 		 142 aa  156  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  46.1 
 
 		 142 aa  133  9e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  40.43 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  42.18 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  40.14 
 
 		 150 aa  110  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  39.86 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  38.3 
 
 		 152 aa  97.1  7e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  35 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  35.46 
 
 		 180 aa  92.4  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  36.36 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  38.97 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  36.76 
 
 		 165 aa  90.5  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  41.26 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 		 142 aa  88.6  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  40.29 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  37.06 
 
 		 151 aa  87.8  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  35.04 
 
 		 143 aa  87  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  35.29 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  35.46 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  35.46 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  36.62 
 
 		 147 aa  84.7  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  35.17 
 
 		 150 aa  84  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  35.46 
 
 		 158 aa  84  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 		 145 aa  84  6e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 145 aa  84  7e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 145 aa  83.6  8e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  34.04 
 
 		 152 aa  83.6  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  33.33 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  35 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  35.37 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  33.33 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  38.19 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  35.42 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  36.88 
 
 		 297 aa  81.6  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  33.79 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  36.17 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  39.16 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  36.36 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  35.46 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  34.72 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  36.43 
 
 		 217 aa  77.8  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  36.17 
 
 		 280 aa  77.4  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  34.33 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  33.79 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  33.79 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  33.79 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  33.79 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  33.79 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  33.8 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  33.79 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  32.62 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  35.81 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  31.43 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  33.79 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  36.17 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2164  UspA domain protein  35.66 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  33.1 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  34.9 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  34.69 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  33.56 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  32.64 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  35.57 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  34.75 
 
 		 288 aa  73.6  0.0000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  37.14 
 
 		 297 aa  73.6  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  41.1 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  35.25 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  31.25 
 
 		 152 aa  72  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  34.72 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  34.04 
 
 		 140 aa  72  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  35.07 
 
 		 149 aa  72  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  31.72 
 
 		 155 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  31.21 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  33.56 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 155 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2102  UspA domain protein  35.51 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 155 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  33.79 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  34.51 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  35.21 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2846  hypothetical protein  33.11 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  32.39 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  32.41 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  30.57 
 
 		 182 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  30.57 
 
 		 182 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>