More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5007 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  100 
 
 
217 aa  441  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5116  UspA domain protein  34.38 
 
 
231 aa  96.7  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  39.72 
 
 
180 aa  84.3  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  36.55 
 
 
149 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  51.61 
 
 
150 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  36.43 
 
 
142 aa  77.8  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  35.57 
 
 
149 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  36.2 
 
 
162 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  35.37 
 
 
152 aa  77  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  35.57 
 
 
304 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  57.35 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  38.03 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  34.93 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  34.93 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  34.23 
 
 
280 aa  75.1  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  34.75 
 
 
146 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  38.85 
 
 
159 aa  74.7  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  36.08 
 
 
151 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  35.14 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  37.08 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  57.41 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  36.17 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  32 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  31.21 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  40 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  35.62 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  34 
 
 
162 aa  72  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  34.21 
 
 
151 aa  72  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  31.94 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  33.11 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  34.72 
 
 
143 aa  70.9  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2791  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
155 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119476  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  34.75 
 
 
152 aa  70.9  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  34 
 
 
162 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  35.33 
 
 
162 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  33.1 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  31.72 
 
 
145 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  33.1 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  33.56 
 
 
164 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  61.54 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  34.25 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  40 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  38.69 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  32.43 
 
 
288 aa  70.1  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  33.57 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  31.94 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  33.33 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  34.53 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  52.63 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  32.17 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  32.62 
 
 
290 aa  68.9  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  39.33 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  31.52 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  33.33 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  59.65 
 
 
300 aa  68.6  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  33.56 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  34.42 
 
 
287 aa  68.2  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 
143 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  30.28 
 
 
152 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  46.38 
 
 
149 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5869  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 
148 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135871  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  33.12 
 
 
200 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  31.47 
 
 
153 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  56.86 
 
 
162 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
145 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  34.69 
 
 
147 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  32.41 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  53.45 
 
 
162 aa  67.4  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  30.77 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  32.19 
 
 
157 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  49.09 
 
 
146 aa  67  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  31.84 
 
 
307 aa  67  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  32.24 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  52.73 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  53.57 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  34.51 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  32.39 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  32.87 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  33.97 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  55.56 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  34.62 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  28.66 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4708  hypothetical protein  33.57 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
128 aa  65.9  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  43.28 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.13 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.99 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  54.39 
 
 
296 aa  65.5  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  56.14 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  30.5 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  31.91 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  50.94 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  29.88 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  27.14 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  27.14 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  31.72 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>