More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0866 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  100 
 
 		 280 aa  556  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  43.57 
 
 		 297 aa  205  6e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  39.86 
 
 		 282 aa  192  4e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  36.1 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  34.75 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  28.62 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2471  UspA domain protein  29.5 
 
 		 283 aa  91.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.584159  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2102  UspA domain protein  28.81 
 
 		 289 aa  87  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  32.98 
 
 		 281 aa  86.3  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  27.68 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  27.09 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  29.74 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  30.21 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  29.69 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  31.14 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  27.18 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2211  universal stress protein UspE  26.26 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00209938  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2223  universal stress protein UspE  26.26 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000145957  normal  0.12873 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2161  universal stress protein UspE  26.26 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0882327  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  26.78 
 
 		 449 aa  78.2  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4496  universal stress protein UspE  26.26 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2210  universal stress protein UspE  26.26 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000689351  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  28.62 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  36.09 
 
 		 143 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2223  universal stress protein UspE  26.35 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  31.83 
 
 		 325 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  27.08 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2355  universal stress protein UspE  25.93 
 
 		 310 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0554  UspA domain-containing protein  27.46 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788361 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  28.32 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  28.28 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  35.97 
 
 		 156 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1842  universal stress protein UspE  25.59 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000992679  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  30.53 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  39.86 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  37.5 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  44.2 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  41.73 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1863  universal stress protein UspE  23.33 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.809514  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  38.52 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  26.62 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  32.84 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2416  universal stress protein UspE  24.67 
 
 		 310 aa  72  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.268854  decreased coverage  0.000000187412 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2015  universal stress protein UspE  25.59 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000455059 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1960  universal stress protein UspE  25.59 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2116  universal stress protein UspE  25.59 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.673331  normal  0.0394292 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1950  universal stress protein UspE  25.67 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  36.23 
 
 		 143 aa  71.2  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  29.86 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  37.14 
 
 		 148 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  39.07 
 
 		 158 aa  70.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  31.37 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 		 147 aa  71.2  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2080  universal stress protein UspE  24.05 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  28.23 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  29.21 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1994  universal stress protein UspE  24 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  38.69 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  34.56 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  35.51 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  28.37 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  37.5 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  35.29 
 
 		 150 aa  68.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  34.78 
 
 		 151 aa  68.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  34.91 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  38.78 
 
 		 148 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  39.72 
 
 		 144 aa  68.6  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  29.87 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  35.51 
 
 		 162 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2019  universal stress protein UspE  22.9 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.865134  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  28.76 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1800  universal stress protein UspE  24.16 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.846071  normal  0.320472 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  32.37 
 
 		 159 aa  67.8  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  28.57 
 
 		 301 aa  67  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  26.53 
 
 		 317 aa  67  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  36.5 
 
 		 156 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0260  universal stress protein  38.78 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  41.98 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  31.39 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  24.58 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  34.06 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  28.04 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  27.8 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  26.99 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  32.41 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  40.62 
 
 		 128 aa  65.1  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  32.85 
 
 		 141 aa  65.5  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  35.62 
 
 		 164 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  35.56 
 
 		 138 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  36.57 
 
 		 153 aa  65.1  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  26.91 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  36.5 
 
 		 139 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  25.6 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1832  universal stress protein UspE  22.08 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  20.58 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  36.3 
 
 		 136 aa  63.9  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  33.7 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0806  UspA domain-containing protein  35.07 
 
 		 137 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0671262  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1943  universal stress protein UspE  22.08 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.361169  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  28.62 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>