More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4336 on replicon NC_009431
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  552  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  41.4 
 
 		 297 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  41.49 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  42.91 
 
 		 295 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1453  UspA domain protein  42.56 
 
 		 301 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.870406  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  39.16 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  36.75 
 
 		 286 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  36.4 
 
 		 286 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5472  UspA domain protein  34.28 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.814559 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 306 aa  115  6e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  28.76 
 
 		 295 aa  115  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2918  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519295 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  32.31 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  35.25 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  29.97 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  32.65 
 
 		 294 aa  94  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  31.13 
 
 		 300 aa  93.2  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 291 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1094  hypothetical protein  30.43 
 
 		 291 aa  90.1  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3830  universal stress family protein  29.11 
 
 		 303 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0606263 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  27.99 
 
 		 309 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  31.21 
 
 		 298 aa  89.7  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  26.62 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  30.33 
 
 		 298 aa  87.4  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2212  hypothetical protein  31.08 
 
 		 297 aa  86.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00559639  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  29.8 
 
 		 320 aa  85.9  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  31.72 
 
 		 287 aa  85.9  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  30.39 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  31.62 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  30.03 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3712  universal stress protein  30.28 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2148  hypothetical protein  31.08 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0262  UspA domain protein  32.31 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542285  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  28.24 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  31.02 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  31.14 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  29.49 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0396  hypothetical protein  29.67 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2717  UspA domain-containing protein  26.58 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0554  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788361 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3134  hypothetical protein  28.34 
 
 		 285 aa  75.5  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6021  UspA domain protein  30.99 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  22.95 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  26.71 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  27.3 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0071  hypothetical protein  32.34 
 
 		 308 aa  72  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.677177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  28.04 
 
 		 288 aa  72  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  31.47 
 
 		 149 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  29.77 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  31.25 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  29.9 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  32 
 
 		 151 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  30.2 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  25.81 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  31.93 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1265  hypothetical protein  24.09 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.995311  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  28.72 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  27.7 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  30.14 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 151 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  37.04 
 
 		 145 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3344  UspA domain protein  32.12 
 
 		 141 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  29.04 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7039  UspA domain protein  29.93 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  28.48 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44930  Usp-like protein  27.08 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  27.06 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  25.85 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  31.76 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  36.69 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  23.94 
 
 		 287 aa  65.5  0.0000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  27.4 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  30.37 
 
 		 147 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2256  UspA domain-containing protein  27.88 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1859  UspA domain-containing protein  26.8 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  33.33 
 
 		 187 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  21.79 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  34.29 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  29.04 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  29.61 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  30.61 
 
 		 148 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  38 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1847  UspA domain protein  25.08 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000811482 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  33.1 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  29.83 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  35.97 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0070  UspA domain protein  34.78 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  27.1 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  31.97 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  31.97 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  36.05 
 
 		 156 aa  61.6  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 162 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  27.7 
 
 		 154 aa  61.2  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 159 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 159 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>