More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_56590 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  565  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  98.6 
 
 		 286 aa  559  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  45.39 
 
 		 289 aa  229  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  42.11 
 
 		 282 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2918  UspA domain-containing protein  42.16 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519295 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  37.46 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  36.01 
 
 		 295 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  36.4 
 
 		 289 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1453  UspA domain protein  36.59 
 
 		 301 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.870406  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5472  UspA domain protein  36.2 
 
 		 309 aa  122  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.814559 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  30.14 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  31.99 
 
 		 294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  30.98 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  31.36 
 
 		 306 aa  114  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  32.31 
 
 		 323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  26.33 
 
 		 295 aa  109  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0554  UspA domain-containing protein  31.32 
 
 		 265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788361 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  32.16 
 
 		 293 aa  109  7.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2212  hypothetical protein  32.08 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00559639  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  31.76 
 
 		 298 aa  99.8  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  32.32 
 
 		 298 aa  99.4  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  31.99 
 
 		 309 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3830  universal stress family protein  31.97 
 
 		 303 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0606263 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  30.58 
 
 		 300 aa  96.7  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  30.98 
 
 		 294 aa  96.3  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  30.07 
 
 		 297 aa  96.3  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1859  UspA domain-containing protein  28.42 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1094  hypothetical protein  31.29 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0396  hypothetical protein  29.45 
 
 		 282 aa  89.7  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  31.97 
 
 		 288 aa  89.4  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  32.5 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3134  hypothetical protein  29.43 
 
 		 285 aa  88.2  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  29.33 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45150  universal stress protein  29.43 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66460  hypothetical protein  30.18 
 
 		 271 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6021  UspA domain protein  29.79 
 
 		 352 aa  85.5  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5764  hypothetical protein  29.47 
 
 		 271 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  29.03 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  25.44 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  29.84 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  28.47 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  31.53 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44930  Usp-like protein  29.53 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  28.18 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  29.93 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2015  universal stress protein UspE  28.43 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000455059 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1960  universal stress protein UspE  28.43 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2116  universal stress protein UspE  28.43 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.673331  normal  0.0394292 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0722  hypothetical protein  27.55 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.483462 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3554  UspA domain-containing protein  30.53 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.125802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1288  universal stress protein UspA  24.42 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  32 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2877  UspA domain protein  30.53 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  27.81 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2355  universal stress protein UspE  24.83 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1950  universal stress protein UspE  26.16 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0262  UspA domain protein  30.7 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542285  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2416  universal stress protein UspE  26.4 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.268854  decreased coverage  0.000000187412 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7039  UspA domain protein  27.99 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  24.25 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  27.45 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  27.65 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0418  universal stress protein uspA  32.74 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2210  universal stress protein UspE  25.67 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000689351  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  31.55 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4496  universal stress protein UspE  25.67 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2211  universal stress protein UspE  25.67 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00209938  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2223  universal stress protein UspE  25.67 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000145957  normal  0.12873 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2161  universal stress protein UspE  25.67 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0882327  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1994  universal stress protein UspE  26.07 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2951  universal stress protein UspA  24.68 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.70353  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  26.73 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  29.47 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3607  hypothetical protein  31.08 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  27.3 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1800  universal stress protein UspE  26.67 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.846071  normal  0.320472 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  30.03 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  24.05 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  27.83 
 
 		 281 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2220  universal stress protein UspE  27.33 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.875118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  33.81 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 		 143 aa  67  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2223  universal stress protein UspE  25.08 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  36.69 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  27.73 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1338  UspA domain protein  28.77 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0244136 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  28.67 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0930  universal stress protein UspE  24.5 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  36.76 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  26.86 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  31.21 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  37.69 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  36.23 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2019  universal stress protein UspE  25.33 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.865134  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  32.45 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1842  universal stress protein UspE  25.99 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000992679  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  26.33 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  33.33 
 
 		 154 aa  61.6  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  30.67 
 
 		 153 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>