More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4298 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  100 
 
 		 281 aa  561  1.0000000000000001e-159  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  81.95 
 
 		 278 aa  469  1.0000000000000001e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0262  UspA domain protein  76.16 
 
 		 279 aa  436  1e-121  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542285  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1040  UspA domain protein  74.38 
 
 		 281 aa  400  1e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0924435  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2145  UspA domain protein  74.19 
 
 		 295 aa  384  1e-106  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1847  UspA domain protein  29.66 
 
 		 293 aa  92.4  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000811482 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1158  UspA domain-containing protein  28.98 
 
 		 296 aa  89.4  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  30.84 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2427  UspA domain-containing protein  29.84 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.420316  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0923  UspA domain-containing protein  27.68 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.792635  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2372  UspA domain protein  28.28 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.019406  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  26.26 
 
 		 294 aa  75.5  0.0000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2866  UspA domain-containing protein  26.55 
 
 		 276 aa  75.5  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  34.33 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  30.36 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  32.58 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  32.79 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0255  UspA domain protein  28.67 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955091  normal  0.331109 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  29.57 
 
 		 286 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  29.57 
 
 		 286 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  26.73 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  29.91 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  38.26 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  31.09 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  32.46 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3936  UspA domain protein  30.71 
 
 		 141 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.961196 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  28.91 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  28.44 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  28.51 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1939  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 157 aa  61.6  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  31.48 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  30.99 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  28.22 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  28.99 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1011  UspA domain protein  24.54 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000787918 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1433  GCN5-related N-acetyltransferase  32.67 
 
 		 412 aa  59.7  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.378287  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  29.28 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  36.5 
 
 		 138 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  31.88 
 
 		 153 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2314  UspA domain protein  28.29 
 
 		 153 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1021  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 		 143 aa  58.5  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  27.27 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  26.56 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  24.62 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2244  UspA domain protein  23.75 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.616395 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4203  hypothetical protein  29.58 
 
 		 141 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.470587 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  26.85 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2182  UspA domain protein  23.75 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  27.86 
 
 		 140 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  34.38 
 
 		 128 aa  57.4  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3141  hypothetical protein  32.29 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2707  UspA domain-containing protein  29.6 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  27.59 
 
 		 283 aa  57  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  25.76 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0142  universal stress protein  31.29 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0115208  normal  0.579477 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 		 323 aa  57  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  27.69 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  28.57 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2102  UspA domain protein  28.99 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  25.58 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  28.11 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1094  hypothetical protein  25.16 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0609  UspA domain protein  20.3 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  28.57 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7039  UspA domain protein  26.82 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1453  UspA domain protein  26.34 
 
 		 301 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.870406  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  32.62 
 
 		 143 aa  55.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4990  UspA domain protein  23.28 
 
 		 285 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380571 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0336  hypothetical protein  27.89 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  43.04 
 
 		 148 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  27.6 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  27.5 
 
 		 304 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  32.06 
 
 		 142 aa  54.3  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  31.39 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1348  UspA domain protein  38.96 
 
 		 157 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  28.46 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  26.57 
 
 		 143 aa  53.9  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  29.67 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  27.14 
 
 		 140 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0070  UspA domain protein  30.83 
 
 		 157 aa  53.9  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0352  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 159 aa  53.1  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.818544 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 145 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  34.11 
 
 		 128 aa  53.5  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  26.43 
 
 		 140 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  26.43 
 
 		 140 aa  52.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  34.55 
 
 		 154 aa  52.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 137 aa  52.8  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  35.04 
 
 		 281 aa  52.4  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3796  UspA domain protein  26.87 
 
 		 139 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72021 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  37.61 
 
 		 152 aa  52.8  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  29.79 
 
 		 142 aa  52.4  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  31.25 
 
 		 280 aa  52.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  26.97 
 
 		 154 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2511  UspA domain-containing protein  40.54 
 
 		 143 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.947152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2717  UspA domain-containing protein  39 
 
 		 308 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 		 162 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  29.86 
 
 		 283 aa  52.4  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>