45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2244 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2244  UspA domain protein  100 
 
 
292 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.616395 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2182  UspA domain protein  100 
 
 
292 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1011  UspA domain protein  59.59 
 
 
292 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000787918 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0255  UspA domain protein  39.93 
 
 
291 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955091  normal  0.331109 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0923  UspA domain-containing protein  24.58 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.792635  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  24.32 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  23.75 
 
 
281 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  21.92 
 
 
278 aa  57  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  25.89 
 
 
297 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  21.45 
 
 
307 aa  53.1  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  26.53 
 
 
151 aa  52.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  24.78 
 
 
297 aa  52.4  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  29.2 
 
 
306 aa  50.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2145  UspA domain protein  23.11 
 
 
295 aa  49.3  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  26.39 
 
 
144 aa  48.9  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2084  UspA domain protein  31.07 
 
 
140 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  20.13 
 
 
286 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  25 
 
 
301 aa  46.6  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  26.95 
 
 
140 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1158  UspA domain-containing protein  21.2 
 
 
296 aa  45.8  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  20.65 
 
 
300 aa  45.8  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  22.88 
 
 
290 aa  45.8  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2566  UspA domain-containing protein  26.9 
 
 
143 aa  44.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.31142  normal  0.160987 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4244  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 
144 aa  45.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1767  hypothetical protein  20.62 
 
 
282 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  23.57 
 
 
148 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1040  UspA domain protein  22.78 
 
 
281 aa  43.9  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0924435  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0262  UspA domain protein  19 
 
 
279 aa  44.3  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542285  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0336  hypothetical protein  18.4 
 
 
284 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159298  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  29.69 
 
 
140 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  29.69 
 
 
140 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  25.33 
 
 
159 aa  43.5  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  29.69 
 
 
140 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  29.69 
 
 
140 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  29.69 
 
 
140 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  29.69 
 
 
140 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  29.69 
 
 
140 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3585  UspA domain-containing protein  26.43 
 
 
150 aa  43.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.666006  normal  0.0498222 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  28.12 
 
 
140 aa  43.5  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  23.76 
 
 
317 aa  43.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  25 
 
 
150 aa  43.1  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3936  UspA domain protein  24.16 
 
 
141 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.961196 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  21.09 
 
 
151 aa  42.7  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  22.22 
 
 
415 aa  42.7  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  19.8 
 
 
297 aa  42.4  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>