More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1094 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1094  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  584  1e-166  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  44.18 
 
 		 291 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  44.22 
 
 		 294 aa  205  8e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  42.12 
 
 		 309 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  42.12 
 
 		 291 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  38.57 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  37.41 
 
 		 298 aa  155  9e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  29.93 
 
 		 297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 		 293 aa  115  6e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  30.74 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  31.74 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  32.68 
 
 		 300 aa  95.9  7e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 		 323 aa  93.2  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  31.29 
 
 		 286 aa  92  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  31.29 
 
 		 286 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  25.51 
 
 		 297 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  30.43 
 
 		 289 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  27.33 
 
 		 316 aa  85.9  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  25.97 
 
 		 295 aa  85.9  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0396  hypothetical protein  27.85 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 		 282 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  29.53 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5472  UspA domain protein  33.53 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.814559 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1859  UspA domain-containing protein  27.18 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  39.86 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  39.86 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3134  hypothetical protein  27.7 
 
 		 285 aa  75.5  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  39.44 
 
 		 169 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0418  universal stress protein uspA  28.99 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  25.59 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2212  hypothetical protein  26.33 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00559639  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  26.98 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44930  Usp-like protein  29.33 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  25.42 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2148  hypothetical protein  27.7 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  37.76 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6021  UspA domain protein  28.42 
 
 		 352 aa  69.3  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1453  UspA domain protein  27.42 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.870406  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  26.75 
 
 		 314 aa  67  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  26.52 
 
 		 449 aa  67  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0650  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3554  UspA domain-containing protein  27.31 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.125802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  28.96 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0923  UspA domain-containing protein  25.99 
 
 		 285 aa  65.5  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.792635  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  27 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  25.08 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2877  UspA domain protein  30.13 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  26.95 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2918  UspA domain-containing protein  27.12 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519295 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3830  universal stress family protein  28.81 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0606263 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  30.39 
 
 		 415 aa  62.8  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 145 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7039  UspA domain protein  24.23 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  28.97 
 
 		 149 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  27.69 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  36.11 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  26.13 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  26.07 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  26.94 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  30.33 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.577691 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  27.59 
 
 		 149 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  25.93 
 
 		 288 aa  58.9  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  25.16 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  33.56 
 
 		 159 aa  58.9  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 		 144 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4258  universal stress protein  27.76 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0395352  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  24.59 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1338  UspA domain protein  27.31 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0244136 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  31.61 
 
 		 162 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  30.5 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  24.57 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  28.91 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1265  hypothetical protein  17.98 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.995311  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2866  UspA domain-containing protein  26.56 
 
 		 276 aa  57  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4142  UspA domain-containing protein  28.52 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4983  hypothetical protein  32.69 
 
 		 145 aa  57  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3824  UspA domain protein  31.84 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 149 aa  57  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  25.43 
 
 		 307 aa  57  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  25.08 
 
 		 297 aa  57  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  26.45 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  25.08 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  28.43 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  29.8 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  26.99 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  33.57 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  25.25 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 148 aa  55.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  26.97 
 
 		 151 aa  55.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  34.09 
 
 		 145 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0182  universal stress protein  24.04 
 
 		 281 aa  55.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  29.66 
 
 		 147 aa  54.3  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  27.39 
 
 		 297 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3461  hypothetical protein  26.33 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  33.56 
 
 		 141 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>